RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3EA0A087X179 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3BA6NDS4 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GAGE10A6NGK3 116 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3LB9A6J9 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MSTNO14793 375 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TUBB4AP04350 444 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 HLA-DOAP06340 250 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SPARCP09486 303 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3HP0C7X1 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ALADP13716 330 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB10P40306 273 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RCAN1P53805 252 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TIRAPP58753 221 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MTAPQ13126 283 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CYP20A1Q6UW02 462 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ABRAQ8N0Z2 381 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RFWD2Q8NHY2 731 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SCFD2Q8WU76 684 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RUFY2Q8WXA3 655 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ST8SIA2Q92186 375 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ARRDC3Q96B67 414 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SH3KBP1Q96B97 665 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 VMP1Q96GC9 406 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MASTLQ96GX5 879 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAR2Q96K12 515 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA17Q96L03 361 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ADPGKQ9BRR6 497 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GCM1Q9NP62 436 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KCND2Q9NZV8 630 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF112Q9UJU3 913 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa6.57□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CD6P30203 668 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PCP4P48539 62 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RAC3P60763 192 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PLIN5Q00G26 463 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 BFSP2Q13515 415 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM266Q2M3C6 531 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF766Q5HY98 468 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM151AQ8N4L1 468 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL25Q8N6Q8 603 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 OVCA2Q8WZ82 227 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CD180Q99467 661 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 DPYSL5Q9BPU6 564 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZWILCHQ9H900 591 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 MSL2Q9HCI7 577 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.56□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 BIN1O00499 593 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX2-8O15522 239 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TGFB1I1O43294 461 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 IPO13O94829 963 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM225BP0DP42 221 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 CD19P15391 556 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GLDCP23378 1020 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GRK5P34947 590 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 DPP6P42658 865 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 SEMA3BQ13214 749 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 METTL24Q5JXM2 366 aa6.55□□□□□ -1.36
RABGGTB-209ENST00000473406 KDELC2Q7Z4H8 507 aa6.55□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms