RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462322.2

SMKR1-201, Transcript of small lysine rich protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SMKR1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMKR1-201ENST00000462322 TRIM62Q9BVG3 475 aa25■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa25■■□□□ 1.59
SMKR1-201ENST00000462322 PLCB1Q9NQ66 1216 aa25■■□□□ 1.59
SMKR1-201ENST00000462322 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa25■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 AXIN1O15169 862 aa24.99■■□□□ 1.59
SMKR1-201ENST00000462322 FRYLO94915 3013 aa24.99■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 KCNV2Q8TDN2 545 aa24.99■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 P2RY11Q96G91 374 aa24.99■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 CRY1Q16526 586 aa24.98■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SMKR1-201ENST00000462322 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
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SMKR1-201ENST00000462322 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa24.95■■□□□ 1.58
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SMKR1-201ENST00000462322 UBXN1Q04323 297 aa24.94■■□□□ 1.58
SMKR1-201ENST00000462322 NNTQ13423 1086 aa24.94■■□□□ 1.58
SMKR1-201ENST00000462322 SYCP1Q15431 976 aa24.94■■□□□ 1.58
SMKR1-201ENST00000462322 EFHC1Q5JVL4 640 aa24.94■■□□□ 1.58
SMKR1-201ENST00000462322 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
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