RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	IRAK2	O43187	625 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	KLKB1	P03952	638 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CHRNB1	P11230	501 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GZMA	P12544	262 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GBP1	P32455	592 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC11A2	P49281	568 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TBX4	P57082	545 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FZD5	Q13467	585 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CCIN	Q13939	588 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DCAF6	Q58WW2	860 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	LY6G5C	Q5SRR4	150 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ADGRF1	Q5T601	910 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TAC4	Q86UU9	113 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	VPS36	Q86VN1	386 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CD101	Q93033	1021 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	NT5C3B	Q969T7	300 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	WBP2	Q969T9	261 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CHFR	Q96EP1	664 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC39A13	Q96H72	371 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PIWIL1	Q96J94	861 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHB18P	Q96TA0	734 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CHRD	Q9H2X0	955 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CACNA1I	Q9P0X4	2223 aa		15.24	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A0MRY4	1105 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PI15	O43692	258 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CACNG3	O60359	315 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	F9	P00740	461 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CYBB	P04839	570 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GYPC	P04921	128 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TPM1	P09493	284 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TNFAIP3	P21580	790 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CD72	P21854	359 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	HNRNPH3	P31942	346 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	OPRD1	P41143	372 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ARID5B	Q14865	1188 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PON2	Q15165	354 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GAB4	Q2WGN9	574 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FAM102A	Q5T9C2	384 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MON1B	Q7L1V2	547 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DENND1C	Q8IV53	801 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	VSTM4	Q8IW00	320 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DEFB106A	Q8N104	65 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TTC8	Q8TAM2	541 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	HAUS4	Q9H6D7	363 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	NDRG2	Q9UN36	371 aa	Known RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MTF2	Q9Y483	593 aa	Predicted RBP	15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		15.23	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	APOE	P02649	317 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SERPING1	P05155	500 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	HMBS	P08397	361 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CCR1	P32246	355 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PPP2R5D	Q14738	602 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TAF5	Q15542	800 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MPP7	Q5T2T1	576 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM25	Q86YD3	366 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF557	Q8N988	423 aa	Predicted RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DTWD2	Q8NBA8	298 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	C3orf20	Q8ND61	904 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PNKP	Q96T60	521 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	NPY6R	Q99463	290 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	BBS2	Q9BXC9	721 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC2A11	Q9BYW1	496 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		15.22	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GFRA2	O00451	464 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	ACSL4	O60488	711 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	DCN	P07585	359 aa	Known RBP	15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	CASP14	P31944	242 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GRIA2	P42262	883 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	GALK1	P51570	392 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	PTP4A2	Q12974	167 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	MPPE1	Q53F39	396 aa		15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	15.21	■□□□□ 0.03
PTPA-222	ENST00000445241	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		15.21	■□□□□ 0.03

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