RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444658.7

CCNDBP1-202, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,479 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-202ENST00000444658 UBE3AQ05086 875 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DUSP4Q13115 394 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SEMA3BQ13214 749 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDR2Q16832 855 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 EFHC2Q5JST6 749 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KAZNQ674X7 775 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLHDC10Q6PID8 442 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TADA2BQ86TJ2 420 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SCN4BQ8IWT1 228 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALLCQ8N6M5 410 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PQLC3Q8N755 202 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDZD8Q8NEN9 1154 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCDH19Q8TAB3 1148 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 P3H4Q92791 437 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ART4Q93070 314 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALN1Q9BXU9 219 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BRD8Q9H0E9 1235 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PIGVQ9NUD9 493 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF148Q9UQR1 794 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNU1A8MYU2 1149 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HACD1B0YJ81 288 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 APOL1O14791 398 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 NCAM2O15394 837 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DAPK3O43293 454 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OPA1O60313 960 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZMYND10O75800 440 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 URODP06132 367 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RB1P06400 928 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSH1P0DML2 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSH2P0DML3 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KLRC2P26717 231 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 OAS2P29728 719 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ECHS1P30084 290 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCR1P32246 355 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 GJC1P36383 396 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 BMPR1AP36894 532 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PBX3P40426 434 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 KCNJ1P48048 391 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 NOMO1Q15155 1222 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CA9Q16790 459 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MGAT5BQ3V5L5 792 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB6CQ53S08 254 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CEP128Q6ZU80 1094 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 PCGF5Q86SE9 256 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RFX6Q8HWS3 928 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HERC6Q8IVU3 1022 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 VPS52Q8N1B4 723 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CCDC185Q8N715 623 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ACTL9Q8TC94 416 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RNF139Q8WU17 664 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 IFT81Q8WYA0 676 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 LRRC45Q96CN5 670 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 HAUS1Q96CS2 278 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RTP4Q96DX8 246 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC39A13Q96H72 371 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 B3GALT6Q96L58 329 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 SERPINB11Q96P15 392 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CSPG4P5Q96PW8 444 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 RAB6CQ9H0N0 254 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DDIT4Q9NX09 232 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DONSONQ9NYP3 566 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 DNPEPQ9ULA0 475 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 TLR6Q9Y2C9 796 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 ASB3Q9Y575 518 aa9.59□□□□□ -0.87
CCNDBP1-202ENST00000444658 COL4A6Q14031 1691 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 LTBP2Q14767 1821 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 GOLGA6BA6NDN3 693 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 SLC38A8A6NNN8 435 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 C5orf67F2Z3F1 127 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 H3BRJ5 948 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 IRAK2O43187 625 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 FGF18O76093 207 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 ALDH1A3P47895 512 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 TUBP50607 506 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 RING1Q06587 406 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 ZNF33AQ06730 810 aa9.58□□□□□ -0.88
CCNDBP1-202ENST00000444658 CALCOCO2Q13137 446 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms