RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 NOS2P35228 1153 aa17.56■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 PTPN5P54829 565 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TCF15Q12870 199 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ANO4Q32M45 955 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 DCAF6Q58WW2 860 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ADGRF1Q5T601 910 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ARCQ7LC44 396 aa17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 XYLT1Q86Y38 959 aa17.56■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 ITIH6Q6UXX5 1313 aa17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 LRRC53A6NM62 1247 aa17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 DAB1O75553 588 aa17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 TAC4Q86UU9 113 aa17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SPEM1Q8N4L4 309 aa17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF214Q8ND24 703 aa17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 SYT11Q9BT88 431 aa17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 FBXO4Q9UKT5 387 aa17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 GFRA2O00451 464 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 IRAK2O43187 625 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 LAMTOR5O43504 91 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ATG13O75143 517 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 TYRP14679 529 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFAIP3P21580 790 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 MATKP42679 507 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 MTA1Q13330 715 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 ANGPT1Q15389 498 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 C12orf40Q86WS4 652 aa17.54■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM59LQ9UK28 342 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CAPN11Q9UMQ6 739 aa17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP17.54■□□□□ 0.41e-7■■■□□ 16.6
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RABGEF1-204ENST00000442563 GRAP2O75791 330 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 KAT7O95251 611 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 APODP05090 189 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC2A3P11169 496 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 TNFRSF4P43489 277 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 CCR3P51677 355 aa17.53■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 MPPE1Q53F39 396 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 NUDT18Q6ZVK8 323 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
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RABGEF1-204ENST00000442563 SLC30A5Q8TAD4 765 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAM32Q8TC27 787 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNV2Q8TDN2 545 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 NPY6RQ99463 290 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ARHGEF4Q9NR80 690 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAM22Q9P0K1 906 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 STAP1Q9ULZ2 295 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 MIA3Q5JRA6 1907 aa17.53■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 K7EQS6 105 aa17.52■□□□□ 0.4
RABGEF1-204ENST00000442563 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.4
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