RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 ADGRF2Q8IZF7 708 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CARNMT1Q8N4J0 409 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TNIP2Q8NFZ5 429 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RUFY2Q8WXA3 655 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RABGGTAQ92696 567 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TFAP2CQ92754 450 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB8AQ96BR9 441 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF653Q96CK0 615 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 BORCS6Q96GS4 357 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MASTLQ96GX5 879 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 AJUBAQ96IF1 538 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PHACTR3Q96KR7 559 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 GPHA2Q96T91 129 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TLR10Q9BXR5 811 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 C2orf40Q9H1Z8 148 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NDST4Q9H3R1 872 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MROH8Q9H579 483 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CXorf36Q9H7Y0 433 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 IL23AQ9NPF7 189 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CDYLQ9Y232 598 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RCE1Q9Y256 329 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NEU2Q9Y3R4 380 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 KCNE2Q9Y6J6 123 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MRC2Q9UBG0 1479 aa5.05□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A7PA6NKC0 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ADM5C9JUS6 153 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CTIFO43310 598 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ADAM20O43506 726 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TBX10O75333 385 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT1P04264 644 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ITGB1P05556 798 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF28P17035 718 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 YY1P25490 414 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 EPHA3P29320 983 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 UQCRC1P31930 480 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 HTR7P34969 479 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 THBS4P35443 961 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ATP6V1E1P36543 226 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 GARSP41250 739 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PCP4P48539 62 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RAD23AP54725 363 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 UBXN2AP68543 259 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 RBP5P82980 135 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 HGFACQ04756 655 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 SLFN5Q08AF3 891 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TFCP2Q12800 502 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 BFSP1Q12934 665 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 E2F2Q14209 437 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 USP10Q14694 798 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ACOX1Q15067 660 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MED22Q15528 200 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ODF2Q5BJF6 829 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM196Q5HYL7 178 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR31Q5SQ13 230 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NCEH1Q6PIU2 408 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 KRT27Q7Z3Y8 459 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CCDC91Q7Z6B0 441 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP97Q8IW35 865 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 SLC15A3Q8IY34 581 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 SCML4Q8N228 414 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 POMGNT2Q8NAT1 580 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 OR8H1Q8NGG4 311 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 POC1BQ8TC44 478 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 MGARPQ8TDB4 240 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 POMGNT1Q8WZA1 660 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NCSTNQ92542 709 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ARRDC3Q96B67 414 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PERPQ96FX8 193 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 C5orf34Q96MH7 638 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 NRDE2Q9H7Z3 1164 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 L2HGDHQ9H9P8 463 aa5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CBX1P4-201ENST00000439415 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms