RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434424.5

PTPRK-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRK, Length 555 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-212ENST00000434424 PDCL3Q9H2J4 239 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PRDM13Q9H4Q3 707 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 VPS51Q9UID3 782 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 DAPK1P53355 1430 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 C1orf167Q5SNV9 1468 aa8□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 KIF28PB7ZC32 967 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 KLK10O43240 276 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 LARGE1O95461 756 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 HGFP14210 728 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CPA1P15085 419 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PRKAR1BP31321 381 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 NPTX2P47972 431 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PGDP52209 483 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CHN2P52757 468 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CSRP2Q16527 193 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 NAA35Q5VZE5 725 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MFSD5Q6N075 450 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 DRICH1Q6PGQ1 229 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TMEM108Q6UXF1 575 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TMTC3Q6ZXV5 915 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TRABD2AQ86V40 505 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 STAMQ92783 540 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TEPSINQ96N21 525 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PNKPQ96T60 521 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 GPR20Q99678 358 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 GHITMQ9H3K2 345 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CXorf36Q9H7Y0 433 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TMLHEQ9NVH6 421 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SAC3D1A6NKF1 404 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 B4DLN1 442 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 FFAR3O14843 346 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 AHCYL1O43865 530 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CER1O95813 267 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SPATA31D3P0C874 917 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 GCSHP23434 173 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CCT4P50991 539 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 RAC3P60763 192 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ADAM17P78536 824 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PDCLQ13371 301 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 E2F2Q14209 437 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ZNF569Q5MCW4 686 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MFSD4BQ5TF39 518 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 RASGRP2Q7LDG7 609 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 NGEFQ8N5V2 710 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MBD6Q96DN6 1003 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SMOC2Q9H3U7 446 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 BAG5Q9UL15 447 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 HSF4Q9ULV5 492 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 BCL9LQ86UU0 1499 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PTPRUQ92729 1446 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 A0A1W2PRQ8 180 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SH3D21A4FU49 640 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MATN2O00339 956 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SEPT4O43236 478 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ADRB1P08588 477 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ITGALP20701 1170 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 TGM1P22735 817 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 NTSR1P30989 418 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 PAFAH1B1P43034 410 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CCNIQ14094 377 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 P3H1Q32P28 736 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SPECC1Q5M775 1068 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 UBXN11Q5T124 520 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 CERCAMQ5T4B2 595 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 SLC15A3Q8IY34 581 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 KBTBD2Q8IY47 623 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 APOPT1Q96IL0 206 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 LRIG1Q96JA1 1093 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 MSL2Q9HCI7 577 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 VPS28Q9UK41 221 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 METP08581 1390 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 RALGAPBQ86X10 1494 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRK-212ENST00000434424 RBL1P28749 1068 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 GATMP50440 423 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 CAP1Q01518 475 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 EFEMP1Q12805 493 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRK-212ENST00000434424 CUL4AQ13619 759 aa7.96□□□□□ -1.14
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