RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429160.1

UBXN7-205, Transcript of UBX domain protein 7, human

TSL 2

Gene UBXN7, Length 3,158 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBXN7-205	ENST00000429160	USP33	Q8TEY7	942 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	BBS2	Q9BXC9	721 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SYNC	Q9H7C4	482 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		11.47	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NCAM1	P13591	858 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	OXCT1	P55809	520 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ANO4	Q32M45	955 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	ADGRF1	Q5T601	910 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	UCMA	Q8WVF2	138 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	NOCT	Q9UK39	431 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	STAP1	Q9ULZ2	295 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	MMP17	Q9ULZ9	603 aa		11.46	□□□□□ -0.57
UBXN7-205	ENST00000429160	SYCE3	A1L190	88 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MDM4	O15151	490 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ALDH1A2	O94788	518 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	F9	P00740	461 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CYP1A1	P04798	512 aa	Predicted RBP	11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TPM3	P06753	285 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TYR	P14679	529 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NOS2	P35228	1153 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CACNA2D4	Q7Z3S7	1137 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ERICH1	Q86X53	443 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EBF1	Q9UH73	591 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CYTH4	Q9UIA0	394 aa		11.46	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		H0Y858	1186 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		K7EQS6	105 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ACSL4	O60488	711 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	APBB3	O95704	486 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DGKG	P49619	791 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	APBA1	Q02410	837 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GPR161	Q8N6U8	529 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TERB1	Q8NA31	727 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	HJURP	Q8NCD3	748 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	WBP2	Q969T9	261 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM149B1	Q96BN6	582 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	C18orf8	Q96DM3	657 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EPC1	Q9H2F5	836 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		A0A1W2PQJ5	194 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160		K7ESF4	209 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RNF40	O75150	1001 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TULP3	O75386	442 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SATB1	Q01826	763 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	BRMS1L	Q5PSV4	323 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FYB2	Q5VWT5	728 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	OR6B2	Q6IFH4	312 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NOP9	Q86U38	636 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TMEM25	Q86YD3	366 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DENND1C	Q8IV53	801 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	TTC16	Q8NEE8	873 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EDEM1	Q92611	657 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FCRL2	Q96LA5	508 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CBX8	Q9HC52	389 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	POLM	Q9NP87	494 aa	Predicted RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RAPGEFL1	Q9UHV5	662 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	VCAN	P13611	3396 aa		11.45	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	GFPT2	O94808	682 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	KLKB1	P03952	638 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ERBB2	P04626	1255 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CALB1	P05937	261 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CISD3	P0C7P0	127 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DGKE	P52429	567 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	NOMO3	P69849	1222 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	DMC1	Q14565	340 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SDE2	Q6IQ49	451 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SND1	Q7KZF4	910 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CCDC117	Q8IWD4	279 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CBFA2T2	O43439	604 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SERPINC1	P01008	464 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FYN	P06241	537 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	MATK	P42679	507 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	ANKS1B	Q7Z6G8	1248 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FBRS	Q9HAH7	460 aa		11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	11.44	□□□□□ -0.58
UBXN7-205	ENST00000429160	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		11.44	□□□□□ -0.58

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