RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 FAM72AQ5TYM5 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FAM72DQ6L9T8 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FAM72BQ86X60 149 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO36Q8NEA4 188 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TTC3P53804 2025 aa24.03■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CFAP69A5D8W1 941 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 CDH16O75309 829 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 GCAP28676 217 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 DSC1Q08554 894 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TMED2Q15363 201 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TAOK1Q7L7X3 1001 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 URGCPQ8TCY9 931 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 LGMNQ99538 433 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYND15Q9H091 742 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 PHF24Q9UPV7 400 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM17Q9Y577 477 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NBNO60934 754 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 SELPP16109 830 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 ADRA1BP35368 520 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NR2C2P49116 596 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 NLRP14Q86W24 1093 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 TET1Q8NFU7 2136 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.02■■□□□ 1.443e-6■■■■□ 26.6
FAAP20-209ENST00000428120 CHMP2BQ9UQN3 213 aa24.02■■□□□ 1.44
FAAP20-209ENST00000428120 F5H423 210 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 FAM189BP81408 668 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 BSPRYQ5W0U4 402 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 UNC93B1Q9H1C4 597 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB8Q9UN66 801 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 H3BRJ5 948 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 APRTP07741 180 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 GATMP50440 423 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 SLC39A12Q504Y0 691 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 STKLD1Q8NE28 680 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 DBF4BQ8NFT6 615 aa24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP24.01■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 E7ESA3 106 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 TRAPPC3O43617 180 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 TYMPP19971 482 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 GPNMBQ14956 572 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP24■■□□□ 1.434e-6■■■□□ 17.4
FAAP20-209ENST00000428120 TP53INP2Q8IXH6 220 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 MGARPQ8TDB4 240 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 CCT8L2Q96SF2 557 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ETNK1Q9HBU6 452 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 EURLQ9NYK6 297 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 LGALS13Q9UHV8 139 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 SNX10Q9Y5X0 201 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 METTL18O95568 372 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 VAV1P15498 845 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 GRIK1P39086 918 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 XRCC4Q13426 336 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 RFX8Q6ZV50 586 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 OLFM3Q96PB7 478 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 FAM193BQ96PV7 902 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 COLEC11Q9BWP8 271 aa24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PTPRDP23468 1912 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 NLRC5Q86WI3 1866 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 CHADO15335 359 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ATP5DP30049 168 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ELK3P41970 407 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PM20D1Q6GTS8 502 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PALM2Q8IXS6 379 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ATP11CQ8NB49 1132 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 KLC2Q9H0B6 622 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 MLXIPLQ9NP71 852 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK9Q9NPC2 374 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 HCSTQ9UBK5 93 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 FBXW11Q9UKB1 542 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM120BA0PK00 339 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 IFNAR2P48551 515 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC14Q15048 493 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 VSTM1Q6UX27 236 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 TAC4Q86UU9 113 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 B3GALT6Q96L58 329 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 CEP41Q9BYV8 373 aa23.99■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 GMNCA6NCL1 334 aa23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 SMAPO00193 183 aa23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 PGFP49763 221 aa23.98■■□□□ 1.43
FAAP20-209ENST00000428120 DPYSQ14117 519 aa23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms