RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411265.1

RNU6-1001P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1001, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1001P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TIFAQ96CG3 184 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GRAMD1AQ96CP6 724 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NLRP4Q96MN2 994 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TUBB6Q9BUF5 446 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COLEC11Q9BWP8 271 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PCGF6Q9BYE7 350 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRIM2Q9C040 744 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM234AQ9H0X4 552 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SAP30LQ9HAJ7 183 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RXFP3Q9NSD7 469 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ABHD10Q9NUJ1 306 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEMA5BQ9P283 1151 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PCDHB2Q9Y5E7 798 aa2.6□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A087WZ62 844 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 A0A1W2PPC4 97 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 RRHO14718 337 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 APOL1O14791 398 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KPNA5O15131 536 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNQ3O43525 872 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CBFA2T3O75081 653 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SYF2O95926 243 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TOMM40O96008 361 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VIPP01282 170 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MBPP02686 304 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CBSLP0DN79 551 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NDUFS1P28331 727 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TKTP29401 623 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC8A1P32418 973 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CBSP35520 551 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PBX1P40424 430 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 GSTM5P46439 218 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STT3AP46977 705 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CASP5P51878 434 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZNF543Q08ER8 600 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SEMA3BQ13214 749 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MTX1Q13505 466 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC5A9Q2M3M2 681 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FAM90A2PQ658T7 463 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TTC30AQ86WT1 665 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SAMD14Q8IZD0 417 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MMP21Q8N119 569 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR52L2PQ8NGH6 319 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 P2RY11Q96G91 374 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC136Q96JN2 1154 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SNX27Q96L92 541 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NUDT22Q9BRQ3 303 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HTATIP2Q9BUP3 242 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SCNM1Q9BWG6 230 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TTLL2Q9BWV7 592 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TM2D2Q9BX73 214 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ERVK-5Q9HDB9 667 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 STARD7Q9NQZ5 370 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM45AQ9NWC5 275 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ASNSD1Q9NWL6 643 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 MYO1AQ9UBC5 1043 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 VPS4AQ9UN37 437 aa2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC22A23A1A5C7 686 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 OR2W5A6NFC9 320 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CD8B2A6NJW9 211 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CRYABP02511 175 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 AKR1A1P14550 325 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ST6GAL1P15907 406 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EGR1P18146 543 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PIK3CBP42338 1070 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KCNJ4P48050 445 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 PRIM2P49643 509 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 ATP1A4Q13733 1029 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 P3H1Q32P28 736 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TMEM196Q5HYL7 178 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 KRT27Q7Z3Y8 459 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP2.58□□□□□ -2
RNU6-1001P-201ENST00000411265 SLC44A5Q8NCS7 719 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.1 ms