RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411028.1

RNU6-272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-272P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-272P-201ENST00000411028 TSPAN4O14817 238 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPM1DO15297 605 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 FOXS1O43638 330 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CLEC3BP05452 202 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACADMP11310 421 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 PCP4P48539 62 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 VAV2P52735 878 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SP2Q02086 613 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TLE3Q04726 772 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GEN1Q17RS7 908 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SPDYE7PQ495Y7 208 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 LRRC24Q50LG9 513 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ANKRD40Q6AI12 368 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARMC6Q6NXE6 501 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q6ZRM9 215 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ADSSL1Q8N142 457 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SOCS4Q8WXH5 440 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 MASTLQ96GX5 879 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TEX101Q9BY14 249 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACTRT3Q9BYD9 372 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TPSD1Q9BZJ3 242 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SYNPO2LQ9H987 977 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D29Q9UFV1 150 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS28Q9UK41 221 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SUFUQ9UMX1 484 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCE1Q9Y256 329 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 NOX1Q9Y5S8 564 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3EA0A087X179 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3BA6NDS4 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GAGE10A6NGK3 116 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 AHRRA9YTQ3 701 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3LB9A6J9 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 NPIPB6E9PJ23 425 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 AHCYL1O43865 530 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 RECQL4O94761 1208 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3HP0C7X1 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 UBL4AP11441 157 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 LAMP2P13473 410 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACP5P13686 325 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SCNN1GP51170 649 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 RCAN1P53805 252 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 MAMLD1Q13495 774 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 BFSP2Q13515 415 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CUL4AQ13619 759 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CBFBQ13951 182 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ACSM6Q6P461 480 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 Q6ZSN1 163 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CPLX4Q7Z7G2 160 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GLG1Q92896 1179 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CUL5Q93034 780 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARRDC3Q96B67 414 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CTHRC1Q96CG8 243 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 WDYHV1Q96HA8 205 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 VPS50Q96JG6 964 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC38A3Q99624 504 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 USP44Q9H0E7 712 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 GLOD4Q9HC38 313 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CD207Q9UJ71 328 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 RAB21Q9UL25 225 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.81□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 A1L4Q6 167 aa4.8□□□□□ -1.64
RNU6-272P-201ENST00000411028 AGAP5A6NIR3 686 aa4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.1 ms