RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355560.4

CLK2-201, Transcript of CDC like kinase 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CLK2, Length 2,120 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2-201ENST00000355560 CYP2C18P33260 490 aa26.61■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 CTXN3Q4LDR2 81 aa26.61■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 CENPUQ71F23 418 aa26.61■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 CCDC33Q8N5R6 958 aa26.61■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 I6L893 689 aaPredicted RBP26.6■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 XRCC4Q13426 336 aa26.6■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 HIF1AQ16665 826 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 FAM182AQ5T1J6 154 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 TAC4Q86UU9 113 aa26.6■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.854e-9■■■■□ 26.7
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CLK2-201ENST00000355560 PBX3P40426 434 aa26.6■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 SLC45A4Q5BKX6 768 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 C6orf118Q5T5N4 469 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 ZNF280DQ6N043 979 aa26.6■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 PGLYRP2Q96PD5 576 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 PAK5Q9P286 719 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 MYO16Q9Y6X6 1858 aa26.6■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 PARNO95453 639 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 AMHP03971 560 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 RFX8Q6ZV50 586 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 TLCD1Q96CP7 247 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 CAPS2Q9BXY5 557 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 MICAL3Q7RTP6 2002 aa26.59■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa26.59■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 SMAPO00193 183 aa26.58■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 CXCR3P49682 368 aa26.58■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 FAM72AQ5TYM5 149 aa26.58■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 FAM72DQ6L9T8 149 aa26.58■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 FAM72BQ86X60 149 aa26.58■■□□□ 1.85
CLK2-201ENST00000355560 OLFM3Q96PB7 478 aa26.58■■□□□ 1.85
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CLK2-201ENST00000355560 STKLD1Q8NE28 680 aa26.57■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 TTC25Q96NG3 672 aa26.57■■□□□ 1.84
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CLK2-201ENST00000355560 OR6C75A6NL08 312 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 BANF1O75531 89 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 GPR15P49685 360 aa26.56■■□□□ 1.84
CLK2-201ENST00000355560 AUHQ13825 339 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
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