RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 AP5Z1O43299 807 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KRT86O43790 486 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SRFP11831 508 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SKILP12757 684 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SDHBP21912 280 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PPP3CCP48454 512 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 AP1B1Q10567 949 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PCSK7Q16549 785 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM61Q5EBN2 209 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RFWD3Q6PCD5 774 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC186Q7Z3E2 898 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf127Q8N9H9 656 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 RUFY1Q96T51 708 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 UBXN6Q9BZV1 441 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 FBXL12Q9NXK8 326 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 BACE2Q9Y5Z0 518 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 WDR27A2RRH5 827 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCP110O43303 1012 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC6O75061 913 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PALMO75781 387 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 APBB3O95704 486 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LMO2P25791 158 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CASP5P51878 434 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SARNPP82979 210 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SEMG2Q02383 582 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DMC1Q14565 340 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NCAPHQ15003 741 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GEN1Q17RS7 908 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 C15orf39Q6ZRI6 1047 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PID1Q7Z2X4 250 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR8K1Q8NGG5 319 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SCAMP5Q8TAC9 235 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 PSMB7Q99436 277 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 IGSF6O95976 241 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A1P19634 815 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 TCP11X2Q5H9J9 407 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LYSMD4Q5XG99 296 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TRIM72Q6ZMU5 477 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 SLC44A3Q8N4M1 653 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FOXJ1Q92949 421 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GUCD1Q96NT3 240 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 SAMD15Q9P1V8 674 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAD1L1Q9Y6D9 718 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TTC26A0AVF1 554 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP99D6REC4 459 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 LEFTY2O00292 366 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 GIPC1O14908 333 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-201ENST00000348564 HLA-EP13747 358 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 DRD1P21728 446 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MAOBP27338 520 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 KRT31Q15323 416 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 FAM26DQ5JW98 314 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CYP26C1Q6V0L0 522 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 TAF8Q7Z7C8 310 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 CCDC25Q86WR0 208 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 HID1Q8IV36 788 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 ALLCQ8N6M5 410 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 OR6K2Q8NGY2 324 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 EDAQ92838 391 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-201ENST00000348564 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
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