RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 PCK1P35558 622 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ALS2CR12Q96Q35 445 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 MYADMQ96S97 322 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 KIF9Q9HAQ2 790 aa28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 LRCH4O75427 683 aa28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CXCR3P49682 368 aa28.89■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 SMARCD2Q92925 531 aa28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 SLC39A13Q96H72 371 aa28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 ASB16Q96NS5 453 aa28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 WDCPQ9H6R7 721 aa28.89■■■□□ 2.22
GIPC1-201ENST00000345425 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa28.89■■■□□ 2.22
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GIPC1-201ENST00000345425 PPP2R5DQ14738 602 aa28.88■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 POTEHQ6S545 545 aa28.88■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 UNC45BQ8IWX7 931 aa28.88■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 FAM131BQ86XD5 332 aa28.88■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 LRRC57Q8N9N7 239 aa28.88■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 TCF3P15923 654 aa28.87■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 RAB6CQ9H0N0 254 aa28.87■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 TRPV4Q9HBA0 871 aa28.87■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP28.87■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa28.87■■■□□ 2.21
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GIPC1-201ENST00000345425 PRDM6Q9NQX0 595 aa28.84■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 THEGQ9P2T0 379 aa28.84■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 KCNU1A8MYU2 1149 aa28.83■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
GIPC1-201ENST00000345425 USP4Q13107 963 aa28.83■■■□□ 2.21
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