RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000341935.9

CCR6-201, Transcript of C-C motif chemokine receptor 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCR6, Length 4,018 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR6-201ENST00000341935 CDO1Q16878 200 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RAB6CQ53S08 254 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PM20D1Q6GTS8 502 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CAPRIN2Q6IMN6 1127 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RCOR2Q8IZ40 523 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DEFB106AQ8N104 65 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1958Q8N8K9 716 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FBXO22Q8NEZ5 403 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 EXD1Q8NHP7 514 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SUN5Q8TC36 379 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM172AQ8WUF8 416 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 IRGQQ8WZA9 623 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TMEM169Q96HH4 297 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C8orf48Q96LL4 319 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RAB6CQ9H0N0 254 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CENPHQ9H3R5 247 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZWILCHQ9H900 591 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 AAASQ9NRG9 546 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 BACE2Q9Y5Z0 518 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MTMR11A4FU01 709 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRIT1O00522 736 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TNFRSF10BO14763 440 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SART1O43290 800 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RBP3P10745 1247 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 MATKP42679 507 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPR15P49685 360 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DSG1Q02413 1049 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 VSTM1Q6UX27 236 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HFE2Q6ZVN8 426 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CCDC50Q8IVM0 306 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCN4BQ8IWT1 228 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FIBCD1Q8N539 461 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM81AQ8TBF8 368 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLITRK1Q96PX8 696 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC9A7Q96T83 725 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ZNF446Q9NWS9 450 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 USP18Q9UMW8 372 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 INSL6Q9Y581 213 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CDY1Q9Y6F8 540 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 USP3Q9Y6I4 520 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 E7ENQ6 273 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KRT7P08729 469 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LINC00271P0C7V0 271 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PPM1AP35813 382 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GLUD2P49448 558 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SULT1E1P49888 294 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC5A3P53794 718 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CRYMQ14894 314 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DDR2Q16832 855 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC8B1Q6J4K2 584 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 KIAA1841Q6NSI8 718 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HERC6Q8IVU3 1022 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TTC9BQ8N6N2 239 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SCAMP5Q8TAC9 235 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PEBP4Q96S96 227 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 TBCBQ99426 244 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PCSK1NQ9UHG2 260 aa6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 PRSS47A8MTI9 375 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 C2CD2LO14523 706 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ADAM12O43184 909 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LTFP02788 710 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RPL17P18621 184 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 OAS2P29728 719 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 NOS2P35228 1153 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 DCAF6Q58WW2 860 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 ATAD1Q8NBU5 361 aa6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCR6-201ENST00000341935 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
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