RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 TRAF2Q12933 501 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SGCGQ13326 291 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 SLC39A12Q504Y0 691 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CES3Q6UWW8 571 aa22.96■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 CDH8P55286 799 aa22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.27
PTPRM-201ENST00000332175 KPNA6O60684 536 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 LTFP02788 710 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 RBP1P09455 135 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 RAG1P15918 1043 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 KDM7AQ6ZMT4 941 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 LGI2Q8N0V4 545 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 SOX13Q9UN79 622 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 AMPD1P23109 780 aa22.95■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 PKN1Q16512 942 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 SLC26A11Q86WA9 606 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 MTFR1LQ9H019 292 aa22.95■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 SHMT1P34896 483 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 REPS2Q8NFH8 660 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 MTERF3Q96E29 417 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 KANSL3Q9P2N6 904 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SEC23AQ15436 765 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 C3orf20Q8ND61 904 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 GLMNQ92990 594 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa22.94■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 PDZK1P1A8MUH7 402 aa22.94■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 MCOLN2Q8IZK6 566 aa22.93■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 NOD2Q9HC29 1040 aa22.93■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 SLC2A14Q8TDB8 520 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 FBXO44Q9H4M3 255 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 NDOR1Q9UHB4 597 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 USP17L7P0C7H9 530 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 TPBGLP0DKB5 382 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 FIG4Q92562 907 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 PTPRMP28827 1452 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 VAC14Q08AM6 782 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 TRPC4APQ8TEL6 797 aa22.92■■□□□ 1.26
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PTPRM-201ENST00000332175 ROGDIQ9GZN7 287 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 CD248Q9HCU0 757 aa22.92■■□□□ 1.26
PTPRM-201ENST00000332175 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.92■■□□□ 1.26
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