RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PSMA7O14818 248 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 OPHN1O60890 802 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CUL2Q13617 745 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ISM2Q6H9L7 571 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PIGZQ86VD9 579 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ANKRD52Q8NB46 1076 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 GATA6Q92908 595 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SLC35C1Q96A29 364 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 P2RY11Q96G91 374 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CD93Q9NPY3 652 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 FBXO10Q9UK96 956 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 MAN1B1Q9UKM7 699 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF510Q9Y2H8 683 aa22.13■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TMEM8BA6NDV4 472 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 WASH3PC4AMC7 463 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP33O14559 1287 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 NDUFS2O75306 463 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 KLKB1P03952 638 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SLC8A3P57103 927 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.12■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ZZEF1O43149 2961 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA1EQ15878 2313 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PENKP01210 267 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R2P41236 205 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RAB41Q5JT25 222 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RGL4Q8IZJ4 473 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP18Q8N392 663 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CEP63Q96MT8 703 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 STON1Q9Y6Q2 735 aa22.11■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PI4KAP42356 2102 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SYPP08247 313 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CD44P16070 742 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CHKAP35790 457 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 MFAP3P55082 362 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 COG7P83436 770 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 EFEMP1Q12805 493 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 LRMPQ12912 555 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 STARD3Q14849 445 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SGO2Q562F6 1265 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 FYB2Q5VWT5 728 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 FOXJ1Q92949 421 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 DCLK3Q9C098 648 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SUSD2Q9UGT4 822 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TSPAN16Q9UKR8 245 aa22.1■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PCDH15Q96QU1 1955 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 HMBSP08397 361 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CD19P15391 556 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CD6P30203 668 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 FMO5P49326 533 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TKTL1P51854 596 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 BCAT1P54687 386 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 GEN1Q17RS7 908 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PLEKHG6Q3KR16 790 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 FUT11Q495W5 492 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SYCP2LQ5T4T6 812 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 KLHL10Q6JEL2 608 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CHMP5Q9NZZ3 219 aa22.09■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 AKAP13Q12802 2813 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 SPEGQ15772 3267 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 TULP2O00295 520 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 NPC1O15118 1278 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 ZBED1O96006 694 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CD59P13987 128 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 IL12RB1P42701 662 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PDE4CQ08493 712 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 CCDC40Q4G0X9 1142 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 WDR45BQ5MNZ6 344 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PM20D1Q6GTS8 502 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 UBR7Q8N806 425 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 MARCH2Q9P0N8 246 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 HESX1Q9UBX0 185 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 KLK13Q9UKR3 277 aa22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SOCS1-201ENST00000332029 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa22.07■■□□□ 1.12
SOCS1-201ENST00000332029 H0Y626 953 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms