RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 SERPINA6P08185 405 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SKIP12755 728 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 AQP5P55064 265 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TTLL4Q14679 1199 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ADGRF2Q8IZF7 708 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DERAQ9Y315 318 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 COL1A2P08123 1366 aa23.3■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 H3BRJ5 948 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TSPAN1O60635 241 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MAP3K6O95382 1288 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SESN3P58005 492 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 NBPF20Q3BBV1 942 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 FAM182AQ5T1J6 154 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SLC26A9Q7LBE3 791 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MTMR10Q9NXD2 777 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CSADQ9Y600 493 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 NPTXRO95502 500 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 GSRP00390 522 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ENO1P06733 434 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 GRM5P41594 1212 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SARNPP82979 210 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 NIPAL4Q0D2K0 466 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 STX3Q13277 289 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 NAB1Q13506 487 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 KCTD2Q14681 263 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MROH9Q5TGP6 573 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 KCNT2Q6UVM3 1135 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SCUBE3Q8IX30 993 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 OLFM3Q96PB7 478 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MMP19Q99542 508 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 C20orf27Q9GZN8 174 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DNAJB4Q9UDY4 337 aa23.29■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DPPA5A6NC42 116 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 A6NJR5 290 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SDR42E2A6NKP2 422 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 HACD1B0YJ81 288 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 AOC1P19801 751 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 FDFT1P37268 417 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 RPL34P49207 117 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ARHGAP1Q07960 439 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ACOT1Q86TX2 421 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 KIF12Q96FN5 646 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 FAM161BQ96MY7 647 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CSPG4P5Q96PW8 444 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa23.28■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CITO14578 2027 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DGKIO75912 1065 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 LGALS2P05162 132 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PSEN1P49768 467 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 IGBP1P78318 339 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MBLAC2Q68D91 279 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 UNC93AQ86WB7 457 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 SCUBE1Q8IWY4 988 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 HACE1Q8IYU2 909 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PPFIBP2Q8ND30 876 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TXNRD2Q9NNW7 524 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 AP4E1Q9UPM8 1137 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 AKT3Q9Y243 479 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 NME7Q9Y5B8 376 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 USP3Q9Y6I4 520 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PDHA1P08559 390 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 AMPD1P23109 780 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CPA2P48052 419 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 CCNJLQ8IV13 435 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 FBXO27Q8NI29 283 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 DTLQ9NZJ0 730 aa23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HOXD1-201ENST00000331462 MCM3APO60318 1980 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0A0MRY4 1105 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CCDC189A1A4V9 331 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 GLRA3O75311 464 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 CYP2C8P10632 490 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ACTR3P61158 418 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 ULK2Q8IYT8 1036 aa23.26■■□□□ 1.31
HOXD1-201ENST00000331462 SPATA13Q96N96 652 aa23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.8 ms