RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330149.9

TRAPPC6B-201, Transcript of trafficking protein particle complex 6B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC6B, Length 3,242 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6B-201ENST00000330149 VN1R3Q9BXE9 311 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RXFP1Q9HBX9 757 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 HAO1Q9UJM8 370 aa6□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 USP18Q9UMW8 372 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CCNE2O96020 404 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 NUDT17P0C025 328 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PLA2G4BP0C869 781 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 KLC1Q07866 573 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TRAF1Q13077 416 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SERINC3Q13530 473 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SLC22A25Q6T423 547 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PIGOQ8TEQ8 1089 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RFFLQ8WZ73 363 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 MYADMQ96S97 322 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 NT5C3AQ9H0P0 336 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 GANQ9H2C0 597 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZBTB42B2RXF5 422 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 MEIS1O00470 390 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.99□□□□□ -1.456e-12■□□□□ 9.5
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 RIPK2O43353 540 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CALUO43852 315 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 STAM2O75886 525 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CNPP09543 421 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CREB1P16220 341 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 PON1P27169 355 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 HOXC13P31276 330 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 C11orf91Q3C1V1 193 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ECHDC2Q86YB7 292 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RDH13Q8NBN7 331 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 B3GALT6Q96L58 329 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CCDC77Q9BR77 488 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 SCOCQ9UIL1 159 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 AKT3Q9Y243 479 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 CHRNA3P32297 505 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RASSF2P50749 326 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 IL9RQ01113 521 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZNF460Q14592 562 aa5.99□□□□□ -1.45
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TRAPPC6B-201ENST00000330149 GPR149Q86SP6 731 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 RASGEF1CQ8N431 466 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 PPFIBP2Q8ND30 876 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 DNAJC9Q8WXX5 260 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 HES6Q96HZ4 224 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 THAP2Q9H0W7 228 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 ZBP1Q9H171 429 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 CARD9Q9H257 536 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC6B-201ENST00000330149 C1orf112Q9NSG2 853 aa5.99□□□□□ -1.45
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