RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326828.5

CHRNA3-201, Transcript of cholinergic receptor nicotinic alpha 3 subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHRNA3, Length 3,202 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3-201ENST00000326828 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM174Q8WUU8 243 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 HSFX1Q9UBD0 423 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PSAT1Q9Y617 370 aa14.75□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 H3BSA7 217 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ADCY6O43306 1168 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ALDH1B1P30837 517 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 WASHC5Q12768 1159 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 MYLK3Q32MK0 819 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZBTB46Q86UZ6 589 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 MAP7D3Q8IWC1 876 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ANLNQ9NQW6 1124 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SEPT10Q9P0V9 454 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 BTBD7Q9P203 1132 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF711Q9Y462 761 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZBTB14O43829 449 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 MMP10P09238 476 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 NOMO1Q15155 1222 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 NCSTNQ92542 709 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TWNKQ96RR1 684 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 USP29Q9HBJ7 922 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PPME1Q9Y570 386 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.74□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 KLHL2O95198 593 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PTGER2P43116 358 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CCR10P46092 362 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CA9Q16790 459 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 AAGABQ6PD74 315 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 RXFP2Q8WXD0 754 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CDRT15Q96T59 188 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 RSAD1Q9HA92 442 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PAK5Q9P286 719 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 STRCQ7RTU9 1775 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SIPA1L1O43166 1804 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CRTAMO95727 393 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SMIM18P0DKX4 95 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TYK2P29597 1187 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TGFB2P61812 414 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 OLIG2Q13516 323 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 XYLT1Q86Y38 959 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 FBXW8Q8N3Y1 598 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CMTM5Q96DZ9 223 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 RNF146Q9NTX7 359 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TMEM216Q9P0N5 145 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ATP6V1G1O75348 118 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TMCC1O94876 653 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CSPG5O95196 566 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 HSPA4LO95757 839 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 GJB1P08034 283 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 RPL5P46777 297 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF132P52740 706 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TUBB3Q13509 450 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 FLOT2Q14254 428 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 MBLAC2Q68D91 279 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PLD5Q8N7P1 536 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 GSDMBQ8TAX9 411 aa14.73□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ERVK-10P10266 1014 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 COX4I1P13073 169 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 CRHR1P34998 444 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 RGS2P41220 211 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TAP1Q03518 808 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 Q3C1V9 767 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 WDR78Q5VTH9 848 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SNX32Q86XE0 403 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 PQLC1Q8N2U9 271 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ZNF781Q8N8C0 355 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 ATG4CQ96DT6 458 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 COG4Q9H9E3 785 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 TMCO1Q9UM00 188 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.72□□□□□ -0.05
CHRNA3-201ENST00000326828 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
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