RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 HIC2Q96JB3 615 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CSNK2BP67870 215 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCL15Q16663 113 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MAML3Q96JK9 1138 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TBX20Q9UMR3 447 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 VDRP11473 427 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NAMPTP43490 491 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SBK1Q52WX2 424 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.57□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NPY2RP49146 381 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 GPAMQ9HCL2 828 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NDUFB10O96000 172 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NR1I3Q14994 352 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ASNA1O43681 348 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MYBP10242 640 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MYL4P12829 197 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HALP42357 657 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 COPZ1P61923 177 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CSHL1Q14406 222 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 FNDC5Q8NAU1 212 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CHAMP1Q96JM3 812 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PLA2G6O60733 806 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 AMHP03971 560 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 OR8H2Q8N162 312 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 STK40Q8N2I9 435 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 VCPKMTQ9H867 229 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PSME2Q9UL46 239 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 KIF2BQ8N4N8 673 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 SMARCD1Q96GM5 515 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TNNI3P19429 210 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ATP6V1B2P21281 511 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HPCAL1P37235 193 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HUNKP57058 714 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CBWD2Q8IUF1 395 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ANKRD27Q96NW4 1050 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PANX3Q96QZ0 392 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MAP3K14Q99558 947 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PRR12Q9ULL5 1215 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ERVK-7P63135 1459 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 USP38Q8NB14 1042 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 RIBC2Q9H4K1 309 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ZFP1Q6P2D0 407 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MOXD1Q6UVY6 613 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 POMGNT2Q8NAT1 580 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MCOLN3Q8TDD5 553 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PRKD2Q9BZL6 878 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 DOCK7Q96N67 2140 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 LSM8O95777 96 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 POU1F1P28069 291 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PIK3CGP48736 1102 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 UBE2E3Q969T4 207 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 RERGLQ9H628 205 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 FBXL21Q9UKT6 434 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CORO2BQ9UQ03 480 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TMEM253P0C7T8 217 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CYP2A13Q16696 494 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MIB1Q86YT6 1006 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ADSSL1Q8N142 457 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CPNE1Q99829 537 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 TBL1YQ9BQ87 522 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 REREQ9P2R6 1566 aa9.56□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CPA2P48052 419 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 BHLHB9Q6PI77 547 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 MIER2Q8N344 545 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 ACTR8Q9H981 624 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CRB1P82279 1406 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 WWP2O00308 870 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 HIST1H2ABP04908 130 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 PDHBP11177 359 aa9.55□□□□□ -0.88
CUX1-201ENST00000292535 CCR1P32246 355 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms