RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018810.9

Cbx1-201, Transcript of Chromobox protein homolog 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Cbx1, Length 1,824 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Spata31E9QAF0 1014 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Samd15F6XZJ7 620 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 KlO35082 1014 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Marcksl1P28667 200 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 NrlP54846 237 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 YwhaqP68254 245 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Surf6P70279 355 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 H2-Q2Q4KN81 360 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ehbp1Q69ZW3 1231 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc25Q78PG9 208 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PdhxQ8BKZ9 501 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SgczQ8BX51 311 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gle1Q8R322 699 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Barhl2Q8VIB5 384 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Alg1Q921Q3 482 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tsnaxip1Q99P25 704 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fbxo32Q9CPU7 355 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Snx24Q9CRB0 169 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rin2Q9D684 903 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akr1a1Q9JII6 325 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cog8Q9JJA2 640 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ecel1Q9JMI0 775 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc22a3Q9WTW5 551 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PtprfA2A8L5 1898 aa18.89■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Il27raO70394 623 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atxn1lP0C7T6 687 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Stat5aP42230 793 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 SbdsP70122 250 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 PomkQ3TUA9 349 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ugt3a1Q3UP75 523 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccdc92bQ5SUE3 299 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Orc2Q60862 576 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 AarsQ8BGQ7 968 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 DrgxQ8BYH0 263 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr27Q8C5V5 780 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcdha10Q91Y20 946 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Htra2Q9JIY5 458 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tacc3Q9JJ11 631 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Malrd1A2AJX4 2123 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gpr161B2RPY5 545 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm6205E9PZS2 359 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r11E9Q4X4 861 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pdk4O70571 412 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfy2P20662 777 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ctnnb1Q02248 781 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Afg1lQ3V384 480 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pla2g4dQ50L43 825 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Shroom1Q5SX79 823 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Armc12Q80X86 340 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rassf2Q8BMS9 326 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmx4Q8C0L0 335 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gm6367Q8C6L9 287 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Znf622Q91VY9 476 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 ArskQ9D2L1 553 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Wdr83Q9DAJ4 315 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tmem59Q9QY73 323 aa18.88■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Cep350E9Q309 3095 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhox3cA2AWM0 215 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apol7bB1AQP7 369 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Olfr1022L7MTT3 315 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhox3hL7MU37 215 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Akap1O08715 857 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gfra2O08842 464 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Nek2O35942 443 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Yme1l1O88967 715 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Lrrc6O88978 473 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ccnb1P24860 430 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Skap2Q3UND0 358 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 TceancQ3US16 359 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apol7eQ3UZ24 369 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Rhox3aQ4TU90 215 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ltbp3Q61810 1268 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Defb34Q7TNV8 81 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 LnpkQ7TQ95 425 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Vmn2r43Q80Z08 845 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Bicd1Q8BR07 835 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fam118bQ8C569 351 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 CgasQ8C6L5 507 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Tceal5Q8CCT4 200 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ifi205aQ8CGE8 404 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Fkbp6Q91XW8 327 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Pcdha3Q91Y16 942 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zcchc8Q9CYA6 709 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Syap1Q9D5V6 365 aa18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ppp1r12aQ9DBR7 1029 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Noa1Q9JJG9 693 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Iqcj-Schip1A0A088MLT8 559 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Atp8b4A2ANX3 1194 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Zfp715G3X9T1 886 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Gp6P0C191 313 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Schip1P0DPB4 484 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Slc2a4P14142 509 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Kcnj6P48542 425 aa18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Apobec1P51908 229 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
Cbx1-201ENSMUST00000018810 Ddr1Q03146 911 aa18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.5 ms