RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636120.1

PDE4D-228, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 6,659 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-228ENST00000636120 COG4Q9H9E3 785 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CHST12Q9NRB3 414 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CDH9Q9ULB4 789 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TMCO1Q9UM00 188 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 C16orf96A6NNT2 1141 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CASP5P51878 434 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AIF1P55008 147 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 PPP3CAQ08209 521 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAP2K5Q13163 448 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AP1ARQ63HQ0 302 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 LCA5Q86VQ0 697 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 FAM131BQ86XD5 332 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 EMC1Q8N766 993 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 ACTL9Q8TC94 416 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 HSFY1Q96LI6 401 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 TBL1YQ9BQ87 522 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CCDC134Q9H6E4 229 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 BATF3Q9NR55 127 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 WWOXQ9NZC7 414 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 VTI1BQ9UEU0 232 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 B2RBV5 119 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 AKAP5P24588 427 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 NOS2P35228 1153 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GRM5P41594 1212 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CORO7P57737 925 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 DLG4P78352 724 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 MAMLD1Q13495 774 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 CNGA3Q16281 694 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 GPR142Q7Z601 462 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 IPPQ9Y573 584 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.65□□□□□ -1.34
PDE4D-228ENST00000636120 A0A087X1B8 175 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TBC1D4O60343 1298 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RARAP10276 462 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CALB2P22676 271 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KDELR1P24390 212 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 YWHAQP27348 245 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TUFMP49411 452 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CAPSQ13938 189 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 POLNQ7Z5Q5 900 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 BAP1Q92560 729 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KLRG1Q96E93 195 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 APOPT1Q96IL0 206 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZNF333Q96JL9 665 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 YME1L1Q96TA2 773 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RMND5AQ9H871 391 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB39O15060 712 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 POLE2P56282 527 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MPP3Q13368 585 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C2CD6Q53TS8 623 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAXCQ5TGI0 409 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 FAM162AQ96A26 154 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C17orf80Q9BSJ5 609 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC18Q9H819 358 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 GIMAP4Q9NUV9 329 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 APPL1Q9UKG1 709 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TBKBP1A7MCY6 615 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ALADP13716 330 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 VCLP18206 1134 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ICAM3P32942 547 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PEX19P40855 299 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PSEN1P49768 467 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CDK7P50613 346 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RHOAP61586 193 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 NAA20P61599 178 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 CDK16Q00536 496 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PARP6Q2NL67 630 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MARC1Q5VT66 337 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 LRRC49Q8IUZ0 686 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 MDM1Q8TC05 714 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PGM2Q96G03 612 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 AURKCQ9UQB9 309 aa6.65□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 TMEM150BA6NC51 233 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RASSF10A6NK89 507 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 C2CD2LO14523 706 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 RECQL4O94761 1208 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 PBX1P40424 430 aa6.64□□□□□ -1.35
PDE4D-228ENST00000636120 DNAJC3Q13217 504 aa6.64□□□□□ -1.35
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