RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NAGPAQ9UK23 515 aa28.81■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BCAT2O15382 392 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CILPO75339 1184 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 VNN1O95497 513 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CASP1P29466 404 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IL12RB1P42701 662 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NASPP49321 788 aaPredicted RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 BMT2Q1RMZ1 405 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 IL27RAQ6UWB1 636 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZNB5 142 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TADA2BQ86TJ2 420 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PARD3BQ8TEW8 1205 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SNX19Q92543 992 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa28.8■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTLC2O15270 562 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 OXTRP30559 389 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TPMTP51580 245 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CNNM4Q6P4Q7 775 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 UNC93AQ86WB7 457 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS6Q8IU80 811 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CRYBG2Q8N1P7 616 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00301Q8NCQ3 95 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RASAL2Q9UJF2 1139 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FREM2Q5SZK8 3169 aa28.79■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ITPR1Q14643 2758 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KCNJ18B7U540 433 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 NPC1O15118 1278 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 STC2O76061 302 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF20AO95235 890 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HMBSP08397 361 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MFAP3P55082 362 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GEN1Q17RS7 908 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-BQ31612 363 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHDC10Q6PID8 442 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CLEC20AQ6ZU45 233 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM124AQ86V42 546 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 GOLGA5Q8TBA6 731 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 RHBDD1Q8TEB9 315 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 FBXO10Q9UK96 956 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 MTMR6Q9Y217 621 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa28.78■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 STX6O43752 255 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF132P52740 706 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 SPOPLQ6IQ16 392 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 LRIG1Q96JA1 1093 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CDC6Q99741 560 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 CIPCQ9C0C6 399 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF510Q9Y2H8 683 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 ADAMTS20P59510 1910 aa28.77■■■□□ 2.2
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GVT2 93 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL12A8MUP2 240 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF883P0CG24 379 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 RALAP11233 206 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PIK3CAP42336 1068 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ARID5AQ03989 594 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NUP58Q9BVL2 599 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 MAGEF1Q9HAY2 307 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXD4L1Q9NU39 408 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 NBEAQ8NFP9 2946 aa28.76■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 HHLA1C9JL84 531 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FLRT2O43155 660 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PENKP01210 267 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CYBBP04839 570 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 RPN1P04843 607 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CHKAP35790 457 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 EHHADHQ08426 723 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF234Q14588 700 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 FYB2Q5VWT5 728 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CYFIP2Q96F07 1278 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RY11Q96G91 374 aa28.75■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PPP6R2O75170 966 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 EPHX1P07099 455 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPAP45381 313 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DLG4P78352 724 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 BNC1Q01954 994 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 E2F5Q15329 346 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CCDC157Q569K6 752 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 TAF4BQ92750 862 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 DCLK3Q9C098 648 aa28.74■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 CUTAO60888 179 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 KLKB1P03952 638 aa28.73■■■□□ 2.19
CAPNS1-217ENST00000629983 PRKCHP24723 683 aa28.73■■■□□ 2.19
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