RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 MYL7Q01449 175 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 GRIN1Q05586 938 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 KDSRQ06136 332 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 KCNA1Q09470 495 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 DHCR24Q15392 516 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 RILPL1Q5EBL4 403 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SLFN12LQ6IEE8 588 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 C19orf48Q6RUI8 117 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 PROSER1Q86XN7 944 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 BRSK2Q8IWQ3 736 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ADGRF2Q8IZF7 708 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 TMEM86AQ8N2M4 240 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 FSIP1Q8NA03 581 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SPATA18Q8TC71 538 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 POMGNT1Q8WZA1 660 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SAAL1Q96ER3 474 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SPACA7Q96KW9 195 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 RNF38Q9H0F5 515 aa9.35□□□□□ -0.91
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TTR-204ENST00000610404 CAPN10Q9HC96 672 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SMPD4Q9NXE4 827 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SIX4Q9UIU6 781 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 CPQQ9Y646 472 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ADAMTS20P59510 1910 aa9.35□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 APC2O95996 2303 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ITPR1Q14643 2758 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 FREM2Q5SZK8 3169 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MYMKA6NI61 221 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 OLFM2O95897 454 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 KRT18P05783 430 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 CD59P13987 128 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 LMO2P25791 158 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MAGEA11P43364 429 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SLC7A9P82251 487 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 RESTQ13127 1097 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SOWAHAQ2M3V2 549 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 EOGTQ5NDL2 527 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MCTP1Q6DN14 999 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 FAM171BQ6P995 826 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 RHBDF2Q6PJF5 856 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SFR1Q86XK3 245 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 LRRC52Q8N7C0 313 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 RAD54LQ92698 747 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MYLPFQ96A32 169 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SPATA17Q96L03 361 aa9.34□□□□□ -0.91
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TTR-204ENST00000610404 CAMK1GQ96NX5 476 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 PNKPQ96T60 521 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SYT15Q9BQS2 421 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 FAM213AQ9BRX8 229 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 AKTIPQ9H8T0 292 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 SNX9Q9Y5X1 595 aa9.34□□□□□ -0.91
TTR-204ENST00000610404 ACACAQ13085 2346 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 LAMA5O15230 3695 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GOLGA8IPA6NC78 632 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 ZNF840PA6NDX5 716 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GOLGA8JA6NMD2 632 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 H0Y626 953 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SLC26A4O43511 780 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 OPHN1O60890 802 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 TRIM16O95361 564 aa9.33□□□□□ -0.92
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TTR-204ENST00000610404 APODP05090 189 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SERPINF2P08697 491 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 KRT19P08727 400 aa9.33□□□□□ -0.92
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TTR-204ENST00000610404 BDNFP23560 247 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 PCSK1P29120 753 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 HOXD12P35452 270 aa9.33□□□□□ -0.92
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TTR-204ENST00000610404 LHX1P48742 406 aa9.33□□□□□ -0.92
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TTR-204ENST00000610404 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SCAPQ12770 1279 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 DUOXA1Q1HG43 343 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 SPDYCQ5MJ68 293 aa9.33□□□□□ -0.92
TTR-204ENST00000610404 LY6G5CQ5SRR4 150 aa9.33□□□□□ -0.92
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