RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608287.1

SGMS1-208, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 4

Gene SGMS1, Length 542 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-208ENST00000608287 USP46P62068 366 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 NAXDQ8IW45 347 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 FUKQ8N0W3 1084 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 C12orf29Q8N999 325 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TATDN2Q93075 761 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 TWNKQ96RR1 684 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 CYP2S1Q96SQ9 504 aa20.27■□□□□ 0.84
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SGMS1-208ENST00000608287 KRT82Q9NSB4 513 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 GCNT4Q9P109 453 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 COQ4Q9Y3A0 265 aa20.27■□□□□ 0.84
SGMS1-208ENST00000608287 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 AP1G2O75843 785 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 GNA14O95837 355 aa20.26■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TNFRSF4P43489 277 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 ZNF394Q53GI3 561 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 FAXDC2Q96IV6 333 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.26■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 RAXQ9Y2V3 346 aa20.26■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FREM2Q5SZK8 3169 aa20.26■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 MYH10P35580 1976 aa20.25■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa20.25■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 TTC39CQ8N584 583 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 MLKLQ8NB16 471 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SLC22A12Q96S37 553 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ARID3AQ99856 593 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CISHQ9NSE2 258 aa20.25■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa20.25■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 ADAM32Q8TC27 787 aa20.24■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FOXJ1Q92949 421 aa20.24■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.24■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SLITRK1Q96PX8 696 aa20.24■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 C2orf78A6NCI8 922 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 LEFTY2O00292 366 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ABL1P00519 1130 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FAM200BP0CF97 657 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.837e-14■■■□□ 17.1
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SGMS1-208ENST00000608287 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 MAP3K7CLP57077 242 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CETN1Q12798 172 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TAF10Q12962 218 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 CUL2Q13617 745 aa20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 WDR45BQ5MNZ6 344 aa20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 TRIM59Q8IWR1 403 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
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SGMS1-208ENST00000608287 SMOQ99835 787 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 TBC1D14Q9P2M4 693 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.23■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 LAMA5O15230 3695 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 BEST1O76090 585 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 SLC5A3P53794 718 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 MARSP56192 900 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 KCNH2Q12809 1159 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 FRMD1Q8N878 549 aa20.22■□□□□ 0.83
SGMS1-208ENST00000608287 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.22■□□□□ 0.83
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