RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SYPL2Q5VXT5 272 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM110Q86TL2 294 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FMNL3Q8IVF7 1028 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB106AQ8N104 65 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NUP93Q8N1F7 819 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC35F6Q8N357 371 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ING5Q8WYH8 240 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD13Q8WZ19 329 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXO32Q969P5 355 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 WBP2Q969T9 261 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM149B1Q96BN6 582 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C8orf48Q96LL4 319 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CFAP57Q96MR6 1250 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CORO1BQ9BR76 489 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KLHL11Q9NVR0 708 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 COX16Q9P0S2 106 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANAPC7Q9UJX3 599 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GPSM3Q9Y4H4 160 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa6.32□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 OBSL1O75147 1896 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf78A6NCI8 922 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TRIM66O15016 1216 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCP110O43303 1012 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MSI1O43347 362 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PALMO75781 387 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZMYND10O75800 440 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBED1O96006 694 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LRG1P02750 347 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CALB1P05937 261 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HMBSP08397 361 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KRT3P12035 628 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GABRB2P47870 512 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ALDH1A3P47895 512 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SULT1E1P49888 294 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC6A3Q01959 620 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KIF5AQ12840 1032 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LLGL1Q15334 1064 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF569Q5MCW4 686 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TPGS2Q68CL5 300 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 VSTM1Q6UX27 236 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00114Q6XXX2 140 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM150AQ86TG1 271 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ZSCAN30Q86W11 494 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMC8Q8IU68 726 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TCEAL8Q8IYN2 117 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C3orf20Q8ND61 904 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TTC16Q8NEE8 873 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TPCN2Q8NHX9 752 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RXFP2Q8WXD0 754 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 RFFLQ8WZ73 363 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 HSFY1Q96LI6 401 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 NOX5Q96PH1 765 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 WDR24Q96S15 920 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A12Q96S37 553 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TBCBQ99426 244 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 PSMB7Q99436 277 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC3Q9BY71 257 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAI2Q9GZS0 605 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 CCSER2Q9H7U1 834 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TRPC7Q9HCX4 862 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCB6Q9NP58 842 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 ANLNQ9NQW6 1124 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 SNX10Q9Y5X0 201 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 IRAK3Q9Y616 596 aa6.31□□□□□ -1.4
CAPNS1-208ENST00000589162 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.31□□□□□ -1.4
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