RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 POLR2MP0CAP2 368 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE8P0CG41 777 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 UBL4AP11441 157 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ACTN1P12814 892 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 PDE6AP16499 860 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DPA1P20036 260 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GJA4P35212 333 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GCKP35557 465 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM23P36406 574 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 ARHGDIBP52566 201 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 KRTAP10-9P60411 292 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 PHEXP78562 749 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC25A3Q00325 362 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 ZNF674Q2M3X9 581 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ALG11Q2TAA5 492 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 Q3ZCU0 254 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 AARDQ4LEZ3 155 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 TEX35Q5T0J7 233 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 C6orf89Q6UWU4 347 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE6Q86UF2 777 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 COMTD1Q86VU5 262 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE4Q8IX94 777 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 C7orf57Q8NEG2 295 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 HAS1Q92839 578 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 SNX27Q96L92 541 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC138Q96M89 665 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CMTM3Q96MX0 182 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 EYA3Q99504 573 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 RSAD1Q9HA92 442 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TBCCD1Q9NVR7 557 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 SLC39A1Q9NY26 324 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.23□□□□□ -1.89
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PTPRM-204ENST00000577468 TTC41PQ6P2S7 1318 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC144AA2RUR9 1427 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRM-204ENST00000577468 MAGEB16A2A368 324 aa3.22□□□□□ -1.89
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