RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577256.5

ATG13-223, Transcript of autophagy related 13, human

TSL 4

Gene ATG13, Length 613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG13-223	ENST00000577256	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ZSCAN32	Q9NX65	697 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SIK3	Q9Y2K2	1263 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		18.42	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SYCE3	A1L190	88 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PAPSS1	O43252	624 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TDGF1	P13385	188 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	CYP11B1	P15538	503 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	GRIA2	P42262	883 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SLC6A11	P48066	632 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	KLK7	P49862	253 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	POLR2F	P61218	127 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SYCP1	Q15431	976 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TSSK4	Q6SA08	328 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	BEND5	Q7L4P6	421 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	APTX	Q7Z2E3	356 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PASD1	Q8IV76	773 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ETFBKMT	Q8IXQ9	262 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NELL1	Q92832	810 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PCMTD1	Q96MG8	357 aa	Predicted RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	XPO6	Q96QU8	1125 aa	Known RBP	18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ERGIC2	Q96RQ1	377 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	BBS2	Q9BXC9	721 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	DEC1	Q9P2X7	70 aa		18.41	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256		A0A0A0MRY4	1105 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TULP3	O75386	442 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	KAT7	O95251	611 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NCAM1	P13591	858 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ATP1A3	P13637	1013 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TYR	P14679	529 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	MRE11	P49959	708 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NUDT18	Q6ZVK8	323 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	DENND1C	Q8IV53	801 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	CPXM2	Q8N436	756 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	C1orf131	Q8NDD1	294 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NEK11	Q8NG66	645 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ATRIP	Q8WXE1	791 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	NKD2	Q969F2	451 aa	Predicted RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	ACD	Q96AP0	544 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	SPAG5	Q96R06	1193 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	CPXM1	Q96SM3	734 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256		R4GN57	208 aa		18.4	■□□□□ 0.54
ATG13-223	ENST00000577256		K7EQS6	105 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	MSI1	O43347	362 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	CACNG3	O60359	315 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	LATS1	O95835	1130 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	HOXA6	P31267	233 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	TNFRSF4	P43489	277 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	KDSR	Q06136	332 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	RING1	Q06587	406 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	NNT	Q13423	1086 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	PHTF2	Q8N3S3	785 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	NAT16	Q8N8M0	369 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	SERPINB11	Q96P15	392 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	18.39	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256		K7ESF4	209 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	CAPN9	O14815	690 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	EPHB6	O15197	1021 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	CAVIN2	O95810	425 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	CYBB	P04839	570 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	FYN	P06241	537 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	GLI1	P08151	1106 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	HOXD11	P31277	338 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	CDH5	P33151	784 aa	Predicted RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	SOX5	P35711	763 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	STAT1	P42224	750 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	JAM2	P57087	298 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF445	P59923	1031 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	EFHC1	Q5JVL4	640 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	NUGGC	Q68CJ6	796 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	GRAMD4	Q6IC98	578 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	ZNF677	Q86XU0	584 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	FAM217A	Q8IXS0	508 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	EPS8L1	Q8TE68	723 aa		18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	DQX1	Q8TE96	717 aa	Known RBP	18.38	■□□□□ 0.53
ATG13-223	ENST00000577256	USP33	Q8TEY7	942 aa		18.38	■□□□□ 0.53

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