RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568388.5

SPNS1-210, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-210ENST00000568388 MEI1Q5TIA1 1274 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TMC5Q6UXY8 1006 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PEX26Q7Z412 305 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CD101Q93033 1021 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SERPINB11Q96P15 392 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 GOLPH3Q9H4A6 298 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CCSER2Q9H7U1 834 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 JRKLQ9Y4A0 524 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CLUHO75153 1309 aa19.51■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 IRAK2O43187 625 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RDXP35241 583 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CCR2P41597 374 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 DEUP1Q05D60 604 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TJAP1Q5JTD0 557 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 C10orf120Q5SQS8 335 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 LRRC38Q5VT99 294 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TAC4Q86UU9 113 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SHKBP1Q8TBC3 707 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 S1PR5Q9H228 398 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 ADAM7Q9H2U9 754 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 ATXN3LQ9H3M9 355 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 DNMT3LQ9UJW3 386 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 NUDT5Q9UKK9 219 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 USTQ9Y2C2 406 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HELZP42694 1942 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 BRWD1Q9NSI6 2320 aa19.5■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 A0A1W2PRU2 124 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 COCHO43405 550 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SPOPO43791 374 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TBX18O95935 607 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CTNNA2P26232 953 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 MIPP30301 263 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 LTBRP36941 435 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CXCR3P49682 368 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HADHQ16836 314 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CDO1Q16878 200 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CPNE8Q86YQ8 564 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HES6Q96HZ4 224 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 WDR24Q96S15 920 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 FAM204AQ9H8W3 233 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 DDIT4Q9NX09 232 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CLDND1Q9NY35 253 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 MARCH2Q9P0N8 246 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TLR6Q9Y2C9 796 aa19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP19.49■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 C2orf78A6NCI8 922 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 FTCDO95954 541 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TAS2R40P59535 323 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 NTHL1P78549 312 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 EFEMP1Q12805 493 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SLC5A9Q2M3M2 681 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RAB6CQ53S08 254 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TXNDC8Q6A555 127 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 POLNQ7Z5Q5 900 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RHOT1Q8IXI2 618 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 ADAM32Q8TC27 787 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TCEAL4Q96EI5 215 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SLC39A13Q96H72 371 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 MSLNLQ96KJ4 702 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RNF38Q9H0F5 515 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RAB6CQ9H0N0 254 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TASP1Q9H6P5 420 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PIGVQ9NUD9 493 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 USP18Q9UMW8 372 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HYOU1Q9Y4L1 999 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CUL9Q8IWT3 2517 aa19.48■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CCDC66A2RUB6 948 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PSTPIP1O43586 416 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 TBX10O75333 385 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 KRT7P08729 469 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 HDCP19113 662 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 WEE1P30291 646 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 AIF1P55008 147 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 SLC7A9P82251 487 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 COG7P83436 770 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 CYP4F8P98187 520 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 RING1Q06587 406 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 NME3Q13232 169 aa19.47■□□□□ 0.71
SPNS1-210ENST00000568388 PPP2R5DQ14738 602 aa19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms