RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	CISD3	P0C7P0	127 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF806	P0C7X5	589 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	LCP1	P13796	627 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	CORO1A	P31146	461 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	DGKG	P49619	791 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	GCNT1	Q02742	428 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	ADIG	Q0VDE8	80 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC6	Q16204	474 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	PKDCC	Q504Y2	493 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	PMF1	Q6P1K2	205 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	DENND1C	Q8IV53	801 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	ARHGEF19	Q8IW93	802 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	SCML4	Q8N228	414 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	PGBD3	Q8N328	593 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	C12orf50	Q8NA57	414 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	MLKL	Q8NB16	471 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	RBBP8NL	Q8NC74	664 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	MDGA1	Q8NFP4	955 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	EDEM1	Q92611	657 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	RTKN	Q9BST9	563 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	PLK2	Q9NYY3	685 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	BCCIP	Q9P287	314 aa	Known RBP eCLIP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	FBXO10	Q9UK96	956 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	AGO1	Q9UL18	857 aa	Known RBP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	FRYL	O94915	3013 aa		9.84	□□□□□ -0.83
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR87	Q6ZQQ6	2873 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF292	O60281	2723 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PRRT4	C9JH25	899 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479		M0QYV0	167 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PIK3R2	O00459	728 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MAP3K13	O43283	966 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KRT5	P13647	590 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	NTSR1	P30989	418 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	WAS	P42768	502 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HARS2	P49590	506 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	RGS7	P49802	495 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MFAP3	P55082	362 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DAOA	P59103	153 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIP4	Q15650	581 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FMNL3	Q8IVF7	1028 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CHPF	Q8IZ52	775 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	NETO1	Q8TDF5	533 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	IRGQ	Q8WZA9	623 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GOLGA1	Q92805	767 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PLD4	Q96BZ4	506 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HSFY1	Q96LI6	401 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	VPS45	Q9NRW7	570 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	9.83	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MED7	O43513	233 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GDF9	O60383	454 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GABBR2	O75899	941 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CAVIN2	O95810	425 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CALCA	P01258	141 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HOXB2	P14652	356 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MPL	P40238	635 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	P2RY2	P41231	377 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF132	P52740	706 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CREB5	Q02930	508 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SF3A2	Q15428	464 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MPPE1	Q53F39	396 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FYB2	Q5VWT5	728 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ENOSF1	Q7L5Y1	443 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	CPXM2	Q8N436	756 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	DDI1	Q8WTU0	396 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HMGB4	Q8WW32	186 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	RLN3	Q8WXF3	142 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SPACA7	Q96KW9	195 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM81B	Q96LP2	452 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	ACOX2	Q99424	681 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	MIS12	Q9H081	205 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HCN2	Q9UL51	889 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC27A6	Q9Y2P4	619 aa		9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	9.82	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	GFRA2	O00451	464 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC30A4	O14863	429 aa		9.81	□□□□□ -0.84
KIFC3-231	ENST00000567479	TIMM44	O43615	452 aa		9.81	□□□□□ -0.84

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