RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566452.1

BBS2-215, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, human

TSL 2

Gene BBS2, Length 299 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS2-215	ENST00000566452	TGM1	P22735	817 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ABCD3	P28288	659 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	KCNC1	P48547	511 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	NCKAP1L	P55160	1127 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	LOXL3	P58215	753 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	HGFAC	Q04756	655 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	GALNT2	Q10471	571 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MYBPC2	Q14324	1141 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CSHL1	Q14406	222 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	UBXN2B	Q14CS0	331 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PSMD6	Q15008	389 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PRR31	Q5SQ13	230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ATXN7L2	Q5T6C5	722 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ARMC3	Q5W041	872 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ANO7	Q6IWH7	933 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	LAYN	Q6UX15	382 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF605	Q86T29	641 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SP8	Q8IXZ3	490 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	NGEF	Q8N5V2	710 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PDPR	Q8NCN5	879 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZFP28	Q8NHY6	868 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ABHD5	Q8WTS1	349 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RABGGTA	Q92696	567 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZDHHC12	Q96GR4	267 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RPL10L	Q96L21	214 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SLC46A1	Q96NT5	459 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	NOX5	Q96PH1	765 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TTYH3	Q9C0H2	523 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	GHITM	Q9H3K2	345 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PLA2G3	Q9NZ20	509 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	DNAJB11	Q9UBS4	358 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MET	P08581	1390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	DCLK1	O15075	740 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SPTLC2	O15270	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	DHH	O43323	396 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ANP32C	O43423	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RGS10	O43665	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PEX10	O60683	326 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	URI1	O94763	535 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	LARGE1	O95461	756 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	STARD3NL	O95772	234 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	AKR1B1	P15121	316 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RPL13	P26373	211 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CSF2RB	P32927	897 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	HOXD13	P35453	343 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PGM1	P36871	562 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CDR1	P51861	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	RBM5	P52756	815 aa	Known RBP eCLIP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	GRM4	Q14833	912 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ZNF568	Q3ZCX4	644 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SPATS1	Q496A3	300 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	GALNTL6	Q49A17	601 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MFSD5	Q6N075	450 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	DOK3	Q7L591	496 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SYT13	Q7L8C5	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	R3HCC1L	Q7Z5L2	792 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SPART	Q8N0X7	666 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MBD3L2	Q8NHZ7	208 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MZB1	Q8WU39	189 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	NSUN4	Q96CB9	384 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	GPHA2	Q96T91	129 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	SMO	Q99835	787 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	KCND3	Q9UK17	655 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	PNPLA7	Q6ZV29	1317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	DISP2	A7MBM2	1401 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		4.09	□□□□□ -1.75
BBS2-215	ENST00000566452	KIF1A	Q12756	1690 aa		4.09	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms