RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565296.5

CCNDBP1-206, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,831 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-206ENST00000565296 GZMAP12544 262 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SNX16P57768 344 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CDK17Q00537 523 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 BEND5Q7L4P6 421 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SLC26A9Q7LBE3 791 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SLC44A3Q8N4M1 653 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CEP112Q8N8E3 955 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 WBP2Q969T9 261 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 FAM149B1Q96BN6 582 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SLC2A13Q96QE2 648 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 IGSF9Q9P2J2 1179 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa14.51□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 LEFTY2O00292 366 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 FTLP02792 175 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GLI1P08151 1106 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 EFEMP1Q12805 493 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ZNF77Q15935 545 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ZNF569Q5MCW4 686 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MCOLN2Q8IZK6 566 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NXPE3Q969Y0 559 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ISCUQ9H1K1 167 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 POPDC2Q9HBU9 364 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ASNSD1Q9NWL6 643 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 DNMT3LQ9UJW3 386 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TMEM59LQ9UK28 342 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GOLGA8SH3BPF8 625 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GREM1O60565 184 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 HSF2BPO75031 334 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GJB6O95452 261 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NCAM1P13591 858 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 RRM1P23921 792 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SCNN1AP37088 669 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GSCP56915 257 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SLC20A2Q08357 652 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 FCHO2Q0JRZ9 810 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 GRM2Q14416 872 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 EFHC1Q5JVL4 640 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TRNP1Q6NT89 227 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MSANTD2Q6P1R3 559 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MIB1Q86YT6 1006 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MFSD6LQ8IWD5 586 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NACA2Q9H009 215 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 OBP2AQ9NY56 170 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MARCH2Q9P0N8 246 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CDC23Q9UJX2 597 aa14.5□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MYO16Q9Y6X6 1858 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 RTN2O75298 545 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 NDUFA10O95299 355 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TCF3P15923 654 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 USP4Q13107 963 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TEX35Q5T0J7 233 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TADA2BQ86TJ2 420 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 VPS36Q86VN1 386 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 DEFB106AQ8N104 65 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 RNF139Q8WU17 664 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 E2F7Q96AV8 911 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ADAM33Q9BZ11 813 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TSPYL1Q9H0U9 437 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 KIF9Q9HAQ2 790 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CFAP97Q9P2B7 532 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MUTYHQ9UIF7 546 aa14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 CALB1P05937 261 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 PSMC3P17980 439 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 FLT3P36888 993 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TDGQ13569 410 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 SLC18A3Q16572 532 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 DCAF6Q58WW2 860 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 C3orf20Q8ND61 904 aa14.48□□□□□ -0.09
CCNDBP1-206ENST00000565296 TTC16Q8NEE8 873 aa14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms