RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563559.5

RRN3-205, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, human

TSL 5 BASIC

Gene RRN3, Length 2,128 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RRN3-205	ENST00000563559	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BIRC5	O15392	142 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GSC2	O15499	205 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CRHR1	P34998	444 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TMPRSS15	P98073	1019 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DBN1	Q16643	649 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CMPK2	Q5EBM0	449 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CDHR3	Q6ZTQ4	885 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BEST2	Q8NFU1	509 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	NAF1	Q96HR8	494 aa	Known RBP	19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DHX35	Q9H5Z1	703 aa	Known RBP	19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FAM49B	Q9NUQ9	324 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		19.06	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CAPN15	O75808	1086 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SEMA5A	Q13591	1074 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	HEATR6	Q6AI08	1181 aa	Known RBP	19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	HACE1	Q8IYU2	909 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TEX9	Q8N6V9	391 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	STOML1	Q9UBI4	398 aa		19.05	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	HACD1	B0YJ81	288 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559		H3BRB1	525 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FCHO1	O14526	889 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ENTPD5	O75356	428 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BST1	Q10588	318 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BST2	Q10589	180 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	WWP1	Q9H0M0	922 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	AP4E1	Q9UPM8	1137 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DICER1	Q9UPY3	1922 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	METTL18	O95568	372 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MLN	P12872	115 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FDFT1	P37268	417 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ACADSB	P45954	432 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BCAT1	P54687	386 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GBE1	Q04446	702 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF534	Q76KX8	674 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	OR6B3	Q8NGW1	331 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	KCNV2	Q8TDN2	545 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		19.04	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SCN1A	P35498	2009 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	KAT6A	Q92794	2004 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MAP3K6	O95382	1288 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ZNF286B	P0CG31	522 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CSH1	P0DML2	217 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CSH2	P0DML3	217 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CDC42EP1	Q00587	391 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	OCRL	Q01968	901 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TBCC	Q15814	346 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CCNJL	Q8IV13	435 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	NDUFAF2	Q8N183	169 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DEPDC1B	Q8WUY9	529 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SNX27	Q96L92	541 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CSPG4P5	Q96PW8	444 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	DONSON	Q9NYP3	566 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	FAM237B	A0A1B0GVD1	139 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559		A8MXQ7	604 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	NPTXR	O95502	500 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GCK	P35557	465 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CCNA1	P78396	465 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	CHI3L2	Q15782	390 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ZBTB6	Q15916	424 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GRIK4	Q16099	956 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TTC8	Q8TAM2	541 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		19.03	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	GABBR2	O75899	941 aa		19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	19.02	■□□□□ 0.64
RRN3-205	ENST00000563559	BPGM	P07738	259 aa		19.02	■□□□□ 0.64

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