RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559282.1

BLM-204, Transcript of Bloom syndrome RecQ like helicase, human

TSL 3

Gene BLM, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BLM-204	ENST00000559282	SEMA3B	Q13214	749 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	DNASE1L3	Q13609	305 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CSHL1	Q14406	222 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	KCNJ12	Q14500	433 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	EZH2	Q15910	746 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TMTC4	Q5T4D3	741 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	RANBP10	Q6VN20	620 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TMEM41A	Q96HV5	264 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	HIC2	Q96JB3	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GDF15	Q99988	308 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PCDHB2	Q9Y5E7	798 aa		4.89	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	OR2W5	A6NFC9	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	WIPF3	A6NGB9	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282		H3BNC9	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282		J3KTA2	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PPP6C	O00743	305 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TUBB4A	P04350	444 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ABCG1	P45844	678 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FHL3	Q13643	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PGBD2	Q6P3X8	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TOGARAM2	Q6ZUX3	1019 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CNGA4	Q8IV77	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ZNF527	Q8NB42	609 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	DSCR3	O14972	297 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PIP5K1B	O14986	540 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FFAR2	O15552	330 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CBFA2T3	O75081	653 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MATN1	P21941	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	HTR3A	P46098	478 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CBFB	Q13951	182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CNGA3	Q16281	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CEP78	Q5JTW2	689 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	C18orf8	Q96DM3	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PRR11	Q96HE9	360 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	EPS8L2	Q9H6S3	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PLCB1	Q9NQ66	1216 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	DAAM1	Q9Y4D1	1078 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	WDR17	Q8IZU2	1322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	LATS1	O95835	1130 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CELA2A	P08217	269 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	KEL	P23276	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SERPINB3	P29508	390 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GGT6	Q6P531	493 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	YTHDF3	Q7Z739	585 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GALNT16	Q8N428	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	PRR35	P0CG20	571 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	CDK4	P11802	303 aa		4.85	□□□□□ -1.63
BLM-204	ENST00000559282	NPPB	P16860	134 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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