RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557428.1

PCNX1-215, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 541 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-215ENST00000557428 DPH6Q7L8W6 267 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF720Q7Z2F6 126 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TMPRSS12Q86WS5 348 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GATAD2AQ86YP4 633 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CXorf38Q8TB03 319 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 UCMAQ8WVF2 138 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 OVCA2Q8WZ82 227 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 JAKMIP2Q96AA8 810 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KCNK16Q96T55 309 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NUP58Q9BVL2 599 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 B3GNT5Q9BYG0 378 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CLMPQ9H6B4 373 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 INTS13Q9NVM9 706 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CKAP5Q14008 2032 aa8.52□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MYO18BQ8IUG5 2567 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 H3BQV1 296 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MDM4O15151 490 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 RFPL3O75679 317 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TBX18O95935 607 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 EPHX1P07099 455 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 IDEP14735 1019 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ABCB4P21439 1286 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GARTP22102 1010 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PRKCHP24723 683 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CASP5P51878 434 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FOXK1P85037 733 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PTPRNQ16849 979 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 HES3Q5TGS1 186 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FAM35AQ86V20 835 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GPD1LQ8N335 351 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FAM181AQ8N9Y4 354 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 IGSF8Q969P0 613 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 AK8Q96MA6 479 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LGMNQ99538 433 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CIPCQ9C0C6 399 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TM9SF3Q9HD45 589 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KRT82Q9NSB4 513 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NME7Q9Y5B8 376 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa8.51□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 MGAQ8IWI9 3026 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FAM47DPA6NHR8 397 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SLC26A4O43511 780 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 BRINP1O60477 761 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 AP1G2O75843 785 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 HMBSP08397 361 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TNNI1P19237 187 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TUBP50607 506 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KCNC4Q03721 635 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GRIN1Q05586 938 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TRPC3Q13507 836 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF234Q14588 700 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GEN1Q17RS7 908 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 USP49Q70CQ1 688 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GANCQ8TET4 914 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SORCS1Q8WY21 1168 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SMARCD1Q96GM5 515 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 LHX5Q9H2C1 402 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 NUDT5Q9UKK9 219 aa8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CAPN8A6NHC0 703 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ZNF233A6NK53 670 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ERVH48-1M5A8F1 160 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CYP26A1O43174 497 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SLC28A2O43868 658 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 SEMA4FO95754 770 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ITGAVP06756 1048 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CISD3P0C7P0 127 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 KRT10P13645 584 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 CCDC130P13994 396 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GAP43P17677 238 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ACSL1P33121 698 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ACTN2P35609 894 aa8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PCNX1-215ENST00000557428 GRIA4P48058 902 aa8.49□□□□□ -1.05
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