RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, human

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-231	ENST00000552222	SV2A	Q7L0J3	742 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	LRRC52	Q8N7C0	313 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF513	Q8N8E2	541 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SLC35C1	Q96A29	364 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NAT10	Q9H0A0	1025 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GAREM1	Q9H706	876 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CD248	Q9HCU0	757 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DDX43	Q9NXZ2	648 aa	Known RBP	14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	L1RE1	Q9UN81	338 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	AGAP1	Q9UPQ3	857 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NFE2L3	Q9Y4A8	694 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		14.61	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TBC1D3B	A6NDS4	549 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	KPNA7	A9QM74	516 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	STX10	O60499	249 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CILP	O75339	1184 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	VNN1	O95497	513 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PNPLA4	P41247	253 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GRIA2	P42262	883 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GCLM	P48507	274 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MYL5	Q02045	173 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SLC14A1	Q13336	389 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DHRS13	Q6UX07	377 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GLRX5	Q86SX6	157 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SCUBE3	Q8IX30	993 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SAMSN1	Q9NSI8	373 aa	Known RBP	14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DKK4	Q9UBT3	224 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DSE	Q9UL01	958 aa		14.6	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222		A0A0A0MRY4	1105 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222		J3QKU1	62 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PHACTR2	O75167	634 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	DKK1	O94907	266 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	KRT19	P08727	400 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ADH5	P11766	374 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF165	P49910	485 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	BIRC3	Q13489	604 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NCOA4	Q13772	614 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	BYSL	Q13895	437 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	NCAPH	Q15003	741 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CDKAL1	Q5VV42	579 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	LAYN	Q6UX15	382 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	FAM114A1	Q8IWE2	563 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ZNF560	Q96MR9	790 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	ANP32E	Q9BTT0	268 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	14.59	□□□□□ -0.07
CS-231	ENST00000552222	CBX4	O00257	560 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TRIM66	O15016	1216 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	PMM2	O15305	246 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TULP3	O75386	442 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	STAU1	O95793	577 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	LMO2	P25791	158 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	ATIC	P31939	592 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DPP6	P42658	865 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MYL6	P60660	151 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TSPY1	Q01534	308 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SEMG2	Q02383	582 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IFRD2	Q12894	506 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TRPC3	Q13507	836 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IQCB1	Q15051	598 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HLA-B	Q31612	363 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SV2C	Q496J9	727 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CBWD6	Q4V339	395 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	KRT39	Q6A163	491 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	TMEM25	Q86YD3	366 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	IPO4	Q8TEX9	1081 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HPDL	Q96IR7	371 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	SEMA4C	Q9C0C4	833 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	MMRN2	Q9H8L6	949 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	FANCL	Q9NW38	375 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	DNMT3L	Q9UJW3	386 aa		14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	14.58	□□□□□ -0.08
CS-231	ENST00000552222	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		14.58	□□□□□ -0.08

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