RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 MARCH9Q86YJ5 346 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CBWD2Q8IUF1 395 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ZNF843Q8N446 348 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 WBP2Q969T9 261 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SKA1Q96BD8 255 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CGRRF1Q99675 332 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PANK4Q9NVE7 773 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 NME7Q9Y5B8 376 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SNX11Q9Y5W9 270 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 AK5Q9Y6K8 562 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP12.57□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ASXL3Q9C0F0 2248 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 FRMD3A2A2Y4 597 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 TIMM44O43615 452 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CLSTN1O94985 981 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CST3P01034 146 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CYBBP04839 570 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ITPKBP27987 946 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 MFAP3P55082 362 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CFHR1Q03591 330 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 GRIN1Q05586 938 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CCDC65Q8IXS2 484 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 NRSN2Q9GZP1 204 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 LHX5Q9H2C1 402 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 FBRSQ9HAH7 460 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 KRT82Q9NSB4 513 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 HSPBP1Q9NZL4 362 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 DNMT3LQ9UJW3 386 aa12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.56□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 YKT6O15498 198 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 RFPL3O75679 317 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PENKP01210 267 aaPredicted RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 EPHX1P07099 455 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 COPAP53621 1224 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 C21orf59P57076 290 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SEMG2Q02383 582 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ZNF234Q14588 700 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PSMD6Q15008 389 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 Q6ZNB5 142 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 OR2T3Q8NH03 318 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 BHMTQ93088 406 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 EPSTI1Q96J88 318 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SLC2A11Q9BYW1 496 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 TRIM9Q9C026 710 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 DCLK3Q9C098 648 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 BTBD1Q9H0C5 482 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 VRTNQ9H8Y1 702 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ELOVL2Q9NXB9 296 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PLK2Q9NYY3 685 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SCML2Q9UQR0 700 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP12.55□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 H0Y8X5 98 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ERVH48-1M5A8F1 160 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ENC1O14682 589 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PHACTR2O75167 634 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 TBX18O95935 607 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 P4HA1P13674 534 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CD27P26842 260 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 GJB2P29033 226 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PSEN1P49768 467 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 BCAT1P54687 386 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 COG7P83436 770 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ZBTB16Q05516 673 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 RTP5Q14D33 572 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 GEN1Q17RS7 908 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ZNF667Q5HYK9 610 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 C10orf120Q5SQS8 335 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 PAQR9Q6ZVX9 377 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 FAM124AQ86V42 546 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CIPCQ9C0C6 399 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 LRRC27Q9C0I9 530 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa12.54□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GTQ1 180 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 SEMA4FO95754 770 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 DNTTP04053 509 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ITGAVP06756 1048 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 FAM200BP0CF97 657 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 RALAP11233 206 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 RARGP13631 454 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 ACTN2P35609 894 aa12.53□□□□□ -0.4
CS-228ENST00000551473 STAT6P42226 847 aa12.53□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.9 ms