RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 ENO1P06733 434 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CYP2F1P24903 491 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ADORA2AP29274 412 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 S100A5P33763 92 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RPL3P39023 403 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PPM1LQ5SGD2 360 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MARC1Q5VT66 337 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KAZALD1Q96I82 304 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 USP27XA6NNY8 438 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DEFA1P59665 94 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DEFA3P59666 94 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CHI3L2Q15782 390 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMBIM4Q9HC24 238 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KCNMB3Q9NPA1 279 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RAMP2O60895 175 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KATNA1O75449 491 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PTPRAP18433 802 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MSH3P20585 1137 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PRKCIP41743 596 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 YWHAZP63104 245 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RUNX1T1Q06455 604 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM62Q0P6H9 643 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PTGISQ16647 500 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DENND1BQ6P3S1 775 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CEP70Q8NHQ1 597 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM161AQ9NX61 479 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 UBR1Q8IWV7 1749 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 WNT10BO00744 389 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CD151P48509 253 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GNA13Q14344 377 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MTMR9Q96QG7 549 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DTNAQ9Y4J8 743 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SLITRK3O94933 977 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GLI1P08151 1106 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GHRP10912 638 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PEX5P50542 639 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SLC12A3P55017 1021 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 GTF2BQ00403 316 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 PRKAA1Q13131 559 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MTF1Q14872 753 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 AADATQ8N5Z0 425 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RXFP2Q8WXD0 754 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ATL1Q8WXF7 558 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RABGEF1Q9UJ41 708 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MSRAQ9UJ68 235 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SORCS3Q9UPU3 1222 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 OR6C75A6NL08 312 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 MYCP01106 439 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CKMP06732 381 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CXCR2P25025 360 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CLEC10AQ8IUN9 316 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FBXO36Q8NEA4 188 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DACH2Q96NX9 599 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 NPHS2Q9NP85 383 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SPG21Q9NZD8 308 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ADAM30Q9UKF2 790 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FKBP6O75344 327 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 LGALS2P05162 132 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 KLRK1P26718 216 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SEL1L3Q68CR1 1132 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 VGLL2Q8N8G2 317 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF558Q96NG5 402 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 HTATIP2Q9BUP3 242 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 FICDQ9BVA6 458 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 SENP2Q9HC62 589 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 VANGL2Q9ULK5 521 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 TMCC3Q9ULS5 477 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 F8W810 466 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 CHADO15335 359 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP10O43572 662 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms