RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549589.5

VEZT-222, Transcript of vezatin, adherens junctions transmembrane protein, human

TSL 4

Gene VEZT, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
VEZT-222	ENST00000549589	SHC3	Q92529	594 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KAT5	Q92993	513 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	FAM84A	Q96KN4	292 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	FAM83C	Q9BQN1	747 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SCNM1	Q9BWG6	230 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	DEF6	Q9H4E7	631 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	EBF3	Q9H4W6	596 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	WASF3	Q9UPY6	502 aa		11.14	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ADAMTS20	P59510	1910 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	LNP1	A1A4G5	178 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PNMA6A	P0CW24	399 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CXCL8	P10145	99 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CEACAM1	P13688	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CDC25C	P30307	473 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GALK1	P51570	392 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CDR1	P51861	262 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	AMPD2	Q01433	879 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GCNT1	Q02742	428 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	VEPH1	Q14D04	833 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	C10orf76	Q5T2E6	689 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TRIM68	Q6AZZ1	485 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TRAPPC11	Q7Z392	1133 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KIAA1328	Q86T90	577 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KIF18A	Q8NI77	898 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	JAKMIP2	Q96AA8	810 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CHFR	Q96EP1	664 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GCNA	Q96QF7	691 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PI4K2A	Q9BTU6	479 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ASB7	Q9H672	318 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	APOBEC3G	Q9HC16	384 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	HPS4	Q9NQG7	708 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	INVS	Q9Y283	1065 aa		11.13	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ATP8B3	O60423	1300 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63	7e-7	■■■■■ 34.7
VEZT-222	ENST00000549589	FANCG	O15287	622 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PHACTR2	O75167	634 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	DRD1	P21728	446 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SLC19A1	P41440	591 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PIK3CA	P42336	1068 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TUFM	P49411	452 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	AARS	P49588	968 aa	Known RBP eCLIP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GUCY2F	P51841	1108 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	DGKE	P52429	567 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TERF1	P54274	439 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	BIRC3	Q13489	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ZBTB6	Q15916	424 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TAF12	Q16514	161 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TMEM259	Q4ZIN3	620 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	SYT13	Q7L8C5	426 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CD302	Q8IX05	232 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	EFCAB13	Q8IY85	973 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	RPLP0P6	Q8NHW5	317 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GIPC2	Q8TF65	315 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	WDR24	Q96S15	920 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	IRX2	Q9BZI1	471 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TMEM9B	Q9NQ34	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	MAP10	Q9P2G4	905 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	DNAI1	Q9UI46	699 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	UBQLN1	Q9UMX0	589 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CNTN6	Q9UQ52	1028 aa		11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	FRY	Q5TBA9	3013 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KRT86	O43790	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	KIF5C	O60282	957 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	APBB3	O95704	486 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ASS1	P00966	412 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ARSA	P15289	507 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ATF6	P18850	670 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TYMP	P19971	482 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CYP3A5	P20815	502 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	CSRP1	P21291	193 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	ACO1	P21399	889 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	TNFAIP3	P21580	790 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	AVPR1A	P37288	418 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	MYL6	P60660	151 aa		11.11	□□□□□ -0.63
VEZT-222	ENST00000549589	GNG11	P61952	73 aa		11.11	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms