RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544244.5

PTPRO-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRO, Length 3,978 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-210ENST00000544244 GABRB2P47870 512 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 PPP2R5EQ16537 467 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC142Q17RM4 750 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GPR158Q5T848 1215 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NUGGCQ68CJ6 796 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 GSTA5Q7RTV2 222 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CHSY1Q86X52 802 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 WDTC1Q8N5D0 677 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FNIP1Q8TF40 1166 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 HAUS1Q96CS2 278 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRO-210ENST00000544244 SFXN1Q9H9B4 322 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 CLDND1Q9NY35 253 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRO-210ENST00000544244 FAM50BQ9Y247 325 aa5.9□□□□□ -1.46
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PTPRO-210ENST00000544244 C19orf67A6NJJ6 358 aa5.9□□□□□ -1.47
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PTPRO-210ENST00000544244 BEST1O76090 585 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ABLIM3O94929 683 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TJP3O95049 919 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TPI1P60174 286 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SLC25A52Q3SY17 297 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TMC5Q6UXY8 1006 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 STRADAQ7RTN6 431 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FAM131BQ86XD5 332 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 JOSD2Q8TAC2 188 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 LRRC45Q96CN5 670 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CFAP57Q96MR6 1250 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SMPD4Q9NXE4 827 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CLIC5Q9NZA1 410 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NUDT5Q9UKK9 219 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 USP18Q9UMW8 372 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IRAK3Q9Y616 596 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GRID2IPA4D2P6 1211 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 YJEFN3A6XGL0 299 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 E7ENQ6 273 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PTPN9P43378 593 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TUBB4BP68371 445 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PDK2Q15119 407 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PAQR9Q6ZVX9 377 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC26Q8TAB7 109 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ADAM32Q8TC27 787 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 VWCEQ96DN2 955 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HOMER3Q9NSC5 361 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FBXW11Q9UKB1 542 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TET1Q8NFU7 2136 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RFXAPO00287 272 aa5.89□□□□□ -1.47
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PTPRO-210ENST00000544244 KRIT1O00522 736 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SLC9A3R1O14745 358 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MTA2O94776 668 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SEC24AO95486 1093 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 EPCAMP16422 314 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PCK1P35558 622 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IRS1P35568 1242 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
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PTPRO-210ENST00000544244 BRMS1LQ5PSV4 323 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ERMARDQ5T6L9 678 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SLC22A17Q8WUG5 538 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 UBXN4Q92575 508 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CCDC114Q96M63 670 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SYT11Q9BT88 431 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PRKD2Q9BZL6 878 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 KCND1Q9NSA2 647 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C2CD4BA6NLJ0 364 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 F5H5T6 163 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 H7C0C1 242 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 SRGAP2O75044 1071 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C1RP00736 705 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FSHRP23945 695 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MIPP30301 263 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 FLT3P36888 993 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 MTHFRP42898 656 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 GCGRP47871 477 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 ATP5OP48047 213 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 IFNAR2P48551 515 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 NR1H3Q13133 447 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 PKDCCQ504Y2 493 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRO-210ENST00000544244 RABGAP1LQ5R372 815 aa5.89□□□□□ -1.47
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