RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125	AQP12B	A6NM10	295 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	LINC01548	A6NM66	108 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	PRRT4	C9JH25	899 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	BTBD19	C9JJ37	291 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	CLIC1	O00299	241 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	NPPB	P16860	134 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	ALDH18A1	P54886	795 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	ICA1	Q05084	483 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	DNASE1L3	Q13609	305 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	CSHL1	Q14406	222 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	SPARCL1	Q14515	664 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	GATAD2A	Q86YP4	633 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	OVCA2	Q8WZ82	227 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	RITA1	Q96K30	269 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		5.22	□□□□□ -1.57
MDM2-231	ENST00000544125	TISP43	B9A030	160 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MASP2	O00187	686 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FYB1	O15117	783 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PRAMEF2	O60811	474 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NTSR2	O95665	410 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ANXA6	P08133	673 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MMP8	P22894	467 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	GALNS	P34059	522 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KCNB1	Q14721	858 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ELF2	Q15723	593 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PFKFB4	Q16877	469 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf62	Q5T681	223 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	VSTM1	Q6UX27	236 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ZNF782	Q6ZMW2	699 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FZD4	Q9ULV1	537 aa		5.21	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LGALS16	A8MUM7	142 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TMEM232	C9JQI7	657 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125		H3BNC9	293 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PCDH17	O14917	1159 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ASNA1	O43681	348 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TAF5L	O75529	589 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CYP2D6	P10635	497 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ALAD	P13716	330 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	JAK3	P52333	1124 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM14	Q14142	442 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	GRM4	Q14833	912 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ZACN	Q401N2	412 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	AWAT1	Q58HT5	328 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RINT1	Q6NUQ1	792 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NRSN1	Q8IZ57	195 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FAM71B	Q8TC56	605 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	STYX	Q8WUJ0	223 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PMM1	Q92871	262 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FSCN3	Q9NQT6	498 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FBXO28	Q9NVF7	368 aa		5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	GAR1	Q9NY12	217 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	NPC1	O15118	1278 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CTIF	O43310	598 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DNPH1	O43598	174 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TNFRSF6B	O95407	300 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	ITGA5	P08648	1049 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	AKT1	P31749	480 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CBFB	Q13951	182 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	PTK2B	Q14289	1009 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TRIM71	Q2Q1W2	868 aa	Known RBP	5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RANBP10	Q6VN20	620 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DDB2	Q92466	427 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	DPF1	Q92782	380 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	HIC2	Q96JB3	615 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	C5orf34	Q96MH7	638 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	LRFN1	Q9P244	771 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	MAFF	Q9ULX9	164 aa		5.19	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	TTC34	A8MYJ7	566 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	FCHO1	O14526	889 aa		5.18	□□□□□ -1.58
MDM2-231	ENST00000544125	RNF8	O76064	485 aa		5.18	□□□□□ -1.58

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