RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540665.5

TTC28-AS1-221, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC28-AS1, Length 802 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CACNG3O60359 315 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LATS1O95835 1130 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLKB1P03952 638 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CYP11B1P15538 503 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HOXA6P31267 233 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KRT9P35527 623 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SATB1Q01826 763 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NNTQ13423 1086 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM25Q86YD3 366 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZBTB44Q8NCP5 570 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ACDQ96AP0 544 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ERGIC2Q96RQ1 377 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MIS12Q9H081 205 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDR35Q9P2L0 1181 aa16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
TTC28-AS1-221ENST00000540665 K7ESF4 209 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LILRB5O75023 590 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KAT7O95251 611 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IGLV3-27P01718 113 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 APODP05090 189 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF165P49910 485 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 JAM2P57087 298 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SNX16P57768 344 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF445P59923 1031 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RING1Q06587 406 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ANO4Q32M45 955 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PKN3Q6P5Z2 889 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SCUBE3Q8IX30 993 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 WDTC1Q8N5D0 677 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 BBS2Q9BXC9 721 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ASNSD1Q9NWL6 643 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 STOML2Q9UJZ1 356 aa16.89■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DMDP11532 3685 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYCE3A1L190 88 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 K7EQS6 105 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TULP3O75386 442 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PENKP01210 267 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FYNP06241 537 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GLI1P08151 1106 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HMBSP08397 361 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NCAM1P13591 858 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ATP1A3P13637 1013 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TYRP14679 529 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 GRIA2P42262 883 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SLC6A11P48066 632 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HARS2P49590 506 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KLK7P49862 253 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRE11P49959 708 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UBXN1Q04323 297 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYCP1Q15431 976 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TSSK4Q6SA08 328 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SYT13Q7L8C5 426 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZNF677Q86XU0 584 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PASD1Q8IV76 773 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPS8L1Q8TE68 723 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FAM149B1Q96BN6 582 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 SERPINB11Q96P15 392 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CPXM1Q96SM3 734 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POPDC2Q9HBU9 364 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DEC1Q9P2X7 70 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa16.88■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 EPHB6O15197 1021 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 LSM8O95777 96 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CAVIN2O95810 425 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TNFRSF4P43489 277 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 IQCB1Q15051 598 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 FYB2Q5VWT5 728 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TPGS1Q6ZTW0 290 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NUDT18Q6ZVK8 323 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 DENND1CQ8IV53 801 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 UNC45BQ8IWX7 931 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TERB1Q8NA31 727 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 TMEM35BQ8NCS4 154 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 NEK11Q8NG66 645 aa16.87■□□□□ 0.29
TTC28-AS1-221ENST00000540665 KCNV2Q8TDN2 545 aa16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms