RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538545.6

ACTN1-205, Transcript of actinin alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTN1, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1-205ENST00000538545 METTL23Q86XA0 190 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 COLGALT2Q8IYK4 626 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 GPR62Q9BZJ7 368 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 FAM107BQ9H098 131 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 MLXIPLQ9NP71 852 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 DDIT4Q9NX09 232 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 FZD10Q9ULW2 581 aa14.67□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 CYP2C18P33260 490 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 KCNT2Q6UVM3 1135 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.061e-6■■■■■ 30.4
ACTN1-205ENST00000538545 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 SHROOM3Q8TF72 1996 aa14.66□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 BPTFQ12830 3046 aa14.66□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 MSI1O43347 362 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 CDK7P50613 346 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 DSC1Q08554 894 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 TFDP2Q14188 446 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 BBS9Q3SYG4 887 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 RAB41Q5JT25 222 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 BSPRYQ5W0U4 402 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 ZNF670Q9BS34 389 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 VPS37BQ9H9H4 285 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 ARHGEF4Q9NR80 690 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 TAS1R1Q7RTX1 841 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 RNF139Q8WU17 664 aa14.65□□□□□ -0.06
ACTN1-205ENST00000538545 NT5C3BQ969T7 300 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa14.65□□□□□ -0.06
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ACTN1-205ENST00000538545 SLC5A3P53794 718 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 FAM117BQ6P1L5 589 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 TAC4Q86UU9 113 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 PSD3Q9NYI0 1048 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
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ACTN1-205ENST00000538545 DESP17661 470 aa14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTN1-205ENST00000538545 OLIG2Q13516 323 aa14.64□□□□□ -0.07
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