RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534219.5

PTPRJ-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRJ, Length 546 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-206ENST00000534219 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP26.15■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 SETSIPP0DME0 302 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 CHKAP35790 457 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 WASP42768 502 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 UBE2HP62256 183 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 SDE2Q6IQ49 451 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 LCLAT1Q6UWP7 414 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIM59Q8IWR1 403 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 EHBP1Q8NDI1 1231 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 TFAP2BQ92481 460 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 SMOC1Q9H4F8 434 aa26.14■■□□□ 1.78
PTPRJ-206ENST00000534219 AFPP02771 609 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 LCP1P13796 627 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 NTSR1P30989 418 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 DENND1CQ8IV53 801 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIML1Q8N9V2 468 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 LMO3Q8TAP4 145 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RNF139Q8WU17 664 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RLN3Q8WXF3 142 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 VPS45Q9NRW7 570 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
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PTPRJ-206ENST00000534219 STARD13Q9Y3M8 1113 aa26.13■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CACNA1AO00555 2505 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC30A4O14863 429 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 HOXB2P14652 356 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 BCKDHBP21953 392 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RGS7P49802 495 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PLA2G2CQ5R387 149 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 BHLHA9Q7RTU4 235 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ARHGEF19Q8IW93 802 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CHPFQ8IZ52 775 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 KCTD13Q8WZ19 329 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 EDEM1Q92611 657 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 SPACA7Q96KW9 195 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CHMP5Q9NZZ3 219 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA1468Q9P260 1216 aa26.12■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PRRT4C9JH25 899 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 M0QYV0 167 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PIK3R2O00459 728 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 MAP3K13O43283 966 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CYBBP04839 570 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 BRD2P25440 801 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
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PTPRJ-206ENST00000534219 PKDCCQ504Y2 493 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 BSPRYQ5W0U4 402 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PMS2CLQ68D20 193 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 FMNL3Q8IVF7 1028 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 OLIG1Q8TAK6 271 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CNGB3Q9NQW8 809 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 HCN2Q9UL51 889 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa26.11■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 YJEFN3A6XGL0 299 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 E7ENQ6 273 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ZBTB24O43167 697 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CAVIN2O95810 425 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 CALCAP01258 141 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRJ-206ENST00000534219 GCNT1Q02742 428 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 STILQ15468 1287 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PLD4Q96BZ4 506 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ERLEC1Q96DZ1 483 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ACOX2Q99424 681 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RXFP3Q9NSD7 469 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ABCC13Q9NSE7 274 aa26.1■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa26.1■■□□□ 1.77
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PTPRJ-206ENST00000534219 PMF1Q6P1K2 205 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 DDI1Q8WTU0 396 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 SLC35F5Q8WV83 523 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 P2RY11Q96G91 374 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 ZSWIM1Q9BR11 485 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 RWDD2AQ9UIY3 292 aa26.09■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 MYOFQ9NZM1 2061 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 PENKP01210 267 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 KRT5P13647 590 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 DAOAP59103 153 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 TCEAL6Q6IPX3 200 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 FRMD1Q8N878 549 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 TCEAL3Q969E4 200 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 FBXO10Q9UK96 956 aa26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
PTPRJ-206ENST00000534219 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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