RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 TAC4Q86UU9 113 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 BTBD6Q96KE9 485 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TBCBQ99426 244 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GDE1Q9NZC3 331 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 NUDT5Q9UKK9 219 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 HBS1LQ9Y450 684 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa22.94■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 M0QYT0 321 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 IRAK2O43187 625 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 RNF8O76064 485 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GBP1P32455 592 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PCK1P35558 622 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SULT1E1P49888 294 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 HDAC4P56524 1084 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP11AP98196 1134 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR158Q5T848 1215 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CMTM8Q8IZV2 173 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MAB21L3Q8N8X9 362 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 HLA-CQ95604 372 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 DDIT4Q9NX09 232 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH22Q9UJ99 828 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TLR6Q9Y2C9 796 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MOCS3O95396 460 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CEBPBP17676 345 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 RDXP35241 583 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 COG7P83436 770 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 RING1Q06587 406 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 EFEMP1Q12805 493 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MESDQ14696 234 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 NPAS3Q8IXF0 933 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIM58Q8NG06 486 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM172AQ8WUF8 416 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC22A12Q96S37 553 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 NACA2Q9H009 215 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TRPC7Q9HCX4 862 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa22.93■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 LRCH4O75427 683 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 IGLV3-27P01718 113 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 KCNA5P22460 613 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 DAAM2Q86T65 1068 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ZSCAN30Q86W11 494 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ADAM32Q8TC27 787 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 FGF13Q92913 245 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC39A13Q96H72 371 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CYP2S1Q96SQ9 504 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM204AQ9H8W3 233 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PIGVQ9NUD9 493 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ALG6Q9Y672 507 aa22.92■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 H3BQ06 376 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CKMP06732 381 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CXCR3P49682 368 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 DEUP1Q05D60 604 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PPP2R5DQ14738 602 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CDO1Q16878 200 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ALS2CR12Q96Q35 445 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MDM4O15151 490 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 PALMO75781 387 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLC2A3P11169 496 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 AVPR1AP37288 418 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 NME3Q13232 169 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MTA1Q13330 715 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 POTEHQ6S545 545 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MIB1Q86YT6 1006 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 ING5Q8WYH8 240 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 POMKQ9H5K3 350 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 RASAL2Q9UJF2 1139 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CDH7Q9ULB5 785 aa22.9■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MSI1O43347 362 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 KIF5CO60282 957 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 TCF3P15923 654 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CCR1P32246 355 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 CLUL1Q15846 466 aa22.89■■□□□ 1.26
PACSIN3-205ENST00000528462 BRMS1LQ5PSV4 323 aa22.89■■□□□ 1.26
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