RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527952.1

PTPRJ-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRJ, Length 626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-205ENST00000527952 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 EFEMP1Q12805 493 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 DPYDQ12882 1025 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAM9Q13443 819 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ADAM33Q9BZ11 813 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC32A1Q9H598 525 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 IGF2RP11717 2491 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 AKAP13Q12802 2813 aa25.26■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MAPK13O15264 365 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RALAP11233 206 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MAOBP27338 520 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KLHDC10Q6PID8 442 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RGL4Q8IZJ4 473 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MRGPRX1Q96LB2 322 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CAPN10Q9HC96 672 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PNPLA8Q9NP80 782 aa25.25■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF217O75362 1048 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MYL1P05976 194 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SERPINF2P08697 491 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 DPP6P42658 865 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM193AP78312 1265 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 NFIL3Q16649 462 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 GEN1Q17RS7 908 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PIP4P1Q86T03 277 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 HDDC3Q8N4P3 179 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MINDY1Q8N5J2 469 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CEP76Q8TAP6 659 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ARID3AQ99856 593 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM8AQ9HCN3 771 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 USP3Q9Y6I4 520 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 STON1Q9Y6Q2 735 aa25.24■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 NDUFS2O75306 463 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SEMA3BQ13214 749 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 FYB2Q5VWT5 728 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CCDC150Q8NCX0 1101 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 TATDN2Q93075 761 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 FBXO10Q9UK96 956 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CLEC4EQ9ULY5 219 aa25.23■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 OPHN1O60890 802 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 HOXD12P35452 270 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 MFAP3P55082 362 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT85P78386 507 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KRT39Q6A163 491 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KRBA2Q6ZNG9 492 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 TADA2BQ86TJ2 420 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 DENND1CQ8IV53 801 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC4A11Q8NBS3 891 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CISHQ9NSE2 258 aa25.22■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 ARHGAP33O14559 1287 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PENKP01210 267 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 IL12RB1P42701 662 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PSEN1P49768 467 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 RAD23BP54727 409 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 FUT11Q495W5 492 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 PIGZQ86VD9 579 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CACUL1Q86Y37 369 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 TMEM176AQ96HP8 235 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 CLIC5Q9NZA1 410 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 KLK13Q9UKR3 277 aa25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC12A8A0AV02 714 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TULP2O00295 520 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 COG7P83436 770 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PLEKHG6Q3KR16 790 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SORCS1Q8WY21 1168 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GATA6Q92908 595 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CAMK1GQ96NX5 476 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZNF510Q9Y2H8 683 aa25.2■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GFRA2O00451 464 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 CD59P13987 128 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MXI1P50539 228 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 STARD3Q14849 445 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ZCWPW2Q504Y3 356 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 RAB20Q9NX57 234 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 MARCH2Q9P0N8 246 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 SLC27A6Q9Y2P4 619 aa25.19■■□□□ 1.62
PTPRJ-205ENST00000527952 ASPMQ8IZT6 3477 aa25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms