RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 FGBP02675 491 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2D6P10635 497 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PDHBP11177 359 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MCCP23508 829 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SREBF1P36956 1147 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 KIR2DL3P43628 341 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 INHBCP55103 352 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ITGA7Q13683 1181 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TUBA3CQ13748 450 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NEDD9Q14511 834 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CSRP2Q16527 193 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MAP9Q49MG5 647 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 C19orf54Q5BKX5 351 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FNDC7Q5VTL7 733 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TUBA3EQ6PEY2 450 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GLB1L2Q8IW92 636 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NCOA7Q8NI08 942 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PPTC7Q8NI37 304 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 APBB2Q92870 758 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PPP2R3CQ969Q6 453 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RILPL2Q969X0 211 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MVB12AQ96EY5 273 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PDCD2LQ9BRP1 358 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 WDR11Q9BZH6 1224 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NELFAQ9H3P2 528 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LDAHQ9H6V9 325 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC28A3Q9HAS3 691 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 STK39Q9UEW8 545 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TRPS1Q9UHF7 1281 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 COG5Q9UP83 839 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 VWA7Q9Y334 891 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MYH6P13533 1939 aa4.77□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ABHD14A-ACY1A0A1B0GW23 586 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ZBTB5O15062 677 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 AKR1B10O60218 316 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NRP2O60462 931 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 STC2O76061 302 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TOX4O94842 621 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FSBPO95073 299 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PGK1P00558 417 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FOSP01100 380 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CD4P01730 458 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PGK2P07205 417 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FOSL2P15408 326 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PCSK1P29120 753 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCND2P30279 289 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SLC26A2P50443 739 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 NRG3P56975 720 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GBX1Q14549 363 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC181Q5TID7 509 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ARHGEF16Q5VV41 709 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RSPH3Q86UC2 560 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF575Q86XF7 245 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GPR135Q8IZ08 494 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MIER2Q8N344 545 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 USP38Q8NB14 1042 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TRPV1Q8NER1 839 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 OR6J1Q8NGC5 347 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 BADQ92934 168 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SENP7Q9BQF6 1050 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM47Q9BQJ4 181 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ADI1Q9BV57 179 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 C22orf23Q9BZE7 217 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TANC1Q9C0D5 1861 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 OR10A2Q9H208 303 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TRANK1O15050 2925 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa4.76□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PMS2P1A4D2B8 440 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PRAMEF4O60810 478 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 PRDM1O75626 825 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 ADH4P08319 380 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 POLR2MP0CAP2 368 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 TXNP10599 105 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MAKP20794 623 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 FPR1P21462 350 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 XPAP23025 273 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MCM5P33992 734 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 LIFRP42702 1097 aa4.75□□□□□ -1.65
HDAC2-216ENST00000523628 MEOX1P50221 254 aa4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms