RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517052.1

RNU6-448P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 448, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-448P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-448P-201ENST00000517052 CPNE7Q9UBL6 633 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 FZD4Q9ULV1 537 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAFFQ9ULX9 164 aa0.91□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP0.91□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAF1P21675 1872 aa0.9□□□□□ -2.26
RNU6-448P-201ENST00000517052 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRIM43BA6NCK2 446 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C2CD4BA6NLJ0 364 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C16orf96A6NNT2 1141 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZNF814B7Z6K7 855 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RRHO14718 337 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CCP110O43303 1012 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CTIFO43310 598 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CA12O43570 354 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RGS10O43665 173 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRAMEF2O60811 474 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LDB3O75112 727 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RASSF9O75901 435 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIAS2O75928 621 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NDUFB8O95169 186 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLAUP00749 431 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MBPP02686 304 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD63P08962 238 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 IL1R1P14778 569 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CD19P15391 556 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HSPA6P17066 643 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ADRA1DP25100 572 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KLRC1P26715 233 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TACR3P29371 465 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC7A1P30825 629 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NTSR1P30989 418 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HOXA11P31270 313 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MLH1P40692 756 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TAF6P49848 677 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MTHFSP49914 203 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RAB27AP51159 221 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PGDP52209 483 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 COPAP53621 1224 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ITGA8P53708 1063 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RPS16P62249 146 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 B4GALNT1Q00973 533 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 LTBQ06643 244 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 DDR1Q08345 913 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 STK3Q13188 491 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ARHGEF7Q14155 803 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PTPROQ16827 1216 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM110CQ1W6H9 321 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C3orf38Q5JPI3 329 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MANEALQ5VSG8 457 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 CACHD1Q5VU97 1274 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PLAG1Q6DJT9 500 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NADSYN1Q6IA69 706 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GRHL2Q6ISB3 625 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 APOA5Q6Q788 366 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RFX8Q6ZV50 586 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 USP49Q70CQ1 688 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MAEAQ7L5Y9 396 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TFAP2DQ7Z6R9 452 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 C11orf44Q8N8P7 122 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PNPLA1Q8N8W4 532 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FAM71DQ8N9W8 422 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 STAG1Q8WVM7 1258 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 WBP2Q969T9 261 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 MIB2Q96AX9 1013 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GPATCH3Q96I76 525 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SUCLG2Q96I99 432 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HIC2Q96JB3 615 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 FCRL5Q96RD9 977 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 TUBB6Q9BUF5 446 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 STK31Q9BXU1 1019 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 B3GNT5Q9BYG0 378 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 BRINP2Q9C0B6 783 aa0.9□□□□□ -2.27
RNU6-448P-201ENST00000517052 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms