RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SLC5A9	Q2M3M2	681 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402		Q4G0T1	1027 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CRTC1	Q6UUV9	634 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GLCCI1	Q86VQ1	547 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC33	Q8N5R6	958 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PJA1	Q8NG27	643 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	BRI3BP	Q8WY22	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SIGLEC11	Q96RL6	698 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NUDT22	Q9BRQ3	303 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NUAK2	Q9H093	628 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	VPS45	Q9NRW7	570 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ELOVL5	Q9NYP7	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SOCS2	O14508	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CA12	O43570	354 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PRAMEF2	O60811	474 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	EGR1	P18146	543 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MMP8	P22894	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TM4SF4	P48230	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ID2	Q02363	134 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ATP1A4	Q13733	1029 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SEC23B	Q15437	767 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	AWAT1	Q58HT5	328 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	EEF1AKMT2	Q5JPI9	291 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TTC34	A8MYJ7	566 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GABRB3	P28472	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GALNS	P34059	522 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NR4A2	P43354	598 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HSP90AB2P	Q58FF8	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NANOGP1	Q8N7R0	232 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PMM1	Q92871	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SPRTN	Q9H040	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	FAM50B	Q9Y247	325 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PMM2	O15305	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TLR2	O60603	784 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CAND2	O75155	1236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CD63	P08962	238 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CTSA	P10619	480 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GNAL	P38405	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PBX1	P40424	430 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MAPK7	Q13164	816 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CNGA3	Q16281	694 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	KLHDC7A	Q5VTJ3	777 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GDF15	Q99988	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NAA15	Q9BXJ9	866 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ABHD10	Q9NUJ1	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	INPPL1	O15357	1258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	FGF18	O76093	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	VIP	P01282	170 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SLC12A2	P55011	1212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RABEP1	Q15276	862 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MAPKAPK3	Q16644	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GLE1	Q53GS7	698 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC181	Q5TID7	509 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZNF366	Q8N895	744 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	GLMP	Q8WWB7	406 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TBCB	Q99426	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SENP7	Q9BQF6	1050 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MATR3-223	ENST00000514402	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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